手把手教你用GraphPad Prism绘制生存曲线
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&&&&&&& 疾病预后研究中，生存曲线是必不可少的素材之一，其重要性不言而喻。那么，当获取到生存数据后应该如何绘制一幅对得起读者和编辑的生存曲线呢？在目前的科学绘图界，呈现出Sigmaplot，GraphPad Prism和Origin三分天下的局面。据笔者估计，目前国际杂志上发表的论文中，80%图片出自这三大软件之手。这三款软件均可以绘制生存曲线，其中尤以GraphPad Prism的操作最为简单，制图效果也较好。当然，除了这三款软件外，其它一些常用统计软件（比如SPSS）也能绘制生存曲线，但是总体而言，制图效果明显不如上述三大软件。本文拟图解如何在GraphPad Prism中绘制生存曲线。我们假定有以下案例：为研究男女肺癌患者的预后是否相同，某研究者对5名男性肺癌患者和5名女性肺癌患者进行了随访，得到了如下结果：病人编号随访时间（月）结局说明男1101随访10月，患者死于肺癌男2110随访11月，患者未死亡，但是研究终止了男3120随访12月，患者未死亡，但随后失去联系男4130随访13月，患者死于车祸男581随访8月，患者死于肺癌女150随访7月，患者未死亡，但是研究终止了女260随访6月，患者未死亡，但随后失去联系女340随访4月，患者死于与肺癌无关的心脏病女431随访3月，患者死于肺癌女571随访7月，患者死于肺癌需要说明的是，在结局一栏的赋值中，只有0和1是有效数字，不能填写其它数字。GraphPad Prism默认0为结局事件未发生，1为结局时间已发生。在上表中，男2，男3，男4分别代表了三种结局，由于这三种结局中都没有观察到肺癌相关死亡时间，所以其结局都标识为0，而不是1，这在随访研究中被称为删失结果。需要强调的是，本研究的观察终点是肺癌相关死亡事件，所以患者如果死于车祸，其结局应该是0，而不是1。有了上述数据之后，我们就可以进入GraphPad Prism进行绘图了。关于GraphPad Prism的安装，网上有很多教程，读者可自行查阅，本文不再赘述。本文中所采用的GraphPad Prism为6.0版，其它版本的制图方式与该版本大同小异。1 软件的打开按照好GraphPad Prism后，桌面上（或者在安装文件夹下面）上的prism.exe文件，双击之后出现如下界面：进入上述界面后点击选中左侧Survival模式，之后点击Create，如图所示。之后进入了GraphPad Prism的主界面，如图所示：GraphPad Prism主界面的第一个纵列（标识了X的纵列）是用来输入随访时间的，其余纵列则输入病人的结局，每一个纵列代表了一个组。2 数据的录入将上述表格的数据录入，得到如下结果：这里需要解释一下：在标识为“X”的纵列中，共有十个数据，分别是10例病人的随访时间。在标识为Group A的纵列中，共5个数据，标识男性组的5个病人最终的结局。其中0标识终点事件（肺癌相关死亡）未发生，1则表示事件发生。在标识为Group B的纵列中，也共有5个数据，表示女性组5个病人的最终结局，其标识方法与男性组相同。红色方框内的三个空白表格，可以分别填入“Follow up time (month)”、“male”和“female”，这些标识与最后得到的图片的横坐标、分组标识是一致的。3 生存曲线的编辑按照上述方法输入数据后，生存曲线就自动生成了。点击左侧Graph下面的data1，就可以看到右侧的生存曲线了，如图所示：虽然生存曲线的主体工程这样就可以“竣工”了，但是仍然有一些细节需要修饰，以增强图片的“美观性”。比如，在本图中，male组合female组都是用黑色实线相连的，不容易区分。因此，在本例中，笔者打算将右侧的生存曲线标识为红色，以便进行区分。具体的操作方法是双击右侧的生存曲线，可以出现如下界面。图中标识出了对各个选项的解释。设置完成后点击OK，就得到如下效果了：当然，还可以进行一些局部的修饰，比如调整字体，调整刻度范围等，在此就不赘述了，感兴趣的朋友可以自己摸索。4 进行Logrank检验GraphPad Prims还可以对生存曲线进行统计分析。点击左侧的Curve comparison，就可以查看Logrank的统计检验结果。如图所示：在本案例中，其中male组的中数生存期为“undefined”，实际上是表示随访时间太短，删失病例太多，所以无法计算中数生存期。实际上，在随访研究中，如果随访时间足够长，删失病例较少，一般都可以得出中数生存期。另外，在上述分析中所得到了Hazard Ration与Cox模型中的Hazard Ration是不同的，前者是单因素分析的结果，后者则是多因素分析的结果。5 生存曲线的输出当生存曲线绘制好以后，在输出图片之前，可以先将GraphPad Prism文件保存，以便下次编辑。输出图片的具体操作是：首先点击左侧Graph下面的data1，看见右侧显示生存曲线后，点击菜单中的File，然后选择Export，可以进入如下界面：上述操作完成后，生存曲线的绘制就可以“打完收工”了。经软件输出的TIFF格式的图片可以直接递交给杂志。6 结语本文大致图解了采用GraphPad Prism绘制生存曲线的方法。经过上述方法绘制的生存曲线可以直接递交给杂志社，无需任何修饰。笔者采用这种方法帮助多位朋友绘制生存曲线，所得图片从未因 “不符合要求”而被国际杂志以退回。在本案例中，为便于演示，两组研究对象的样本量较小，所以生存曲线不够光滑。如果将数据替换为大样本的数据，将会得到十分平滑的生存曲线。笔者| 胡志德，AME学术沙龙委员、Journal of Thoracic Disease杂志Section Editor (Systematic Review and Meta-analysis)，工作于济南军区总医院实验诊断科，现为第二军医大学临床检验诊断学博士研究生，以第一作者或通讯作者身份发表SCI论文十余篇，并主持国家青年科学基金一项。资料评价：
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【求助】怎样用graphpad prism做多个样本率间的多重比较?
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本人要做多个样本率间的多重比较，可是在graphpad prism软件中没有找到卡方分割法或者类似的功能，请教各位大神
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你好，我现在也遇到到了同样的问题&本人要做多个样本率间的多重比较，可是在graphpad prism软件中没有找到卡方分割法或者类似的功能，请教各位大神&，不知道你的问题解决了吗，如果方便的话能不能发邮件给我说一下呢，谢谢，邮箱：
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可以参考《临床医学研究中的统计分析和图形表达实例详解》一书
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【求助】急求如何用Graphpad Prism5 做2 way ANOVA
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如题：急求如何用Graphpad Prism5 做2 way ANOVA ？
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给你一个例样：3.6
两因素析因方差分析 【例】 2.1 各组小鼠气道反应性的测定此为两因素影响试验资料。A因素为分组因素，B因素为剂量因素。整体分析：为两因素析因方差分析。统计结果两个因素的各水平整体间，有显著性意义（P＜0.05），两因素的交互作用也有统计学意义（P＜0.05）精细比较并结合数据来看： 通过有创肺功能仪检测各组小鼠的基础气道阻力以及激发时气道阻力，发现各组小鼠的基础气道阻力无显著差异，我们分别用0、3.125、6.25、12.5mg/ml四种乙酰甲胆碱浓度对小鼠的气道反应进行激发，发现当乙酰甲胆碱以3.125mg/ml的浓度激发时，各组小鼠的基础气道阻力无显著差异，而当乙酰甲胆碱以6.25、12.5mg/ml的浓度激发时，哮喘模型组小鼠的气道阻力较正常组小鼠显著升高，而氨茶碱治疗组以及地塞米松阳性对照组较哮喘模型组小鼠的气道阻力均显著降低，详细统计比较结果见表1，图1。评点：文字：依然是3个内容组成：整体分析，精细比较，结合数据的解析。当然，组合可以灵活，文字风格也可以多变，只要3个内容都不缺就行。表格：同前两因素重复测量所述，不再赘述。图形：需要多说的就是：两因素析因方差分析，一般建议带个交互作用图。
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山水约定 给你一个例样：3.6
两因素析因方差分析 【例】 2.1 各组小鼠气道反应性的测定此为两因素影响试验资料。A因素为分组因素，B因素为剂量因素。整体分析：为两因素析因方差分析。统计结果两个因素的各水平整体间，有显著性意义（P＜0.05），两因素的交互作用也有统计学意义（P＜0.05）精细比较并结合数据来看： 通过有创肺功能仪检测各组小鼠的基础气道阻力以及激发时气道阻力，发现各组小鼠的基础气道阻力无显著差异，我们分别用0、3.125、6.25、12.5mg/ml四种乙酰甲胆碱浓度对小鼠的气道反应进行激发，发现当乙酰甲胆碱以3.125mg/ml的浓度激发时，各组小鼠的基础气道阻力无显著差异，而当乙酰甲胆碱以6.25、12.5mg/ml的浓度激发时，哮喘模型组小鼠的气道阻力较正常组小鼠显著升高，而氨茶碱治疗组以及地塞米松阳性对照组较哮喘模型组小鼠的气道阻力均显著降低，详细统计比较结果见表1，图1。评点：文字：依然是3个内容组成：整体分析，精细比较，结合数据的解析。当然，组合可以灵活，文字风格也可以多变，只要3个内容都不缺就行。表格：同前两因素重复测量所述，不再赘述。图形：需要多说的就是：两因素析因方差分析，一般建议带个交互作用图。Graphpad，发现A,B两因素均由影响，但是交互作用没有影响Source of Variation% of total variationP valueP value summarySignificant?Interaction2.3820.0725nsNoRow Factor44.93& 0.0001****YesColumn Factor2.1240.0307*Yes是不是就不用画交互图了，当然还是想请较交互图如何画，另外想请问，两两比较如何来做，我的统计结果没有显示呢？
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楼上并没有详细说明怎么做呀？那个连接怎么用呢？谢谢。
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两因素析因方差分析 【例】 2.1 各组小鼠气道反应性的测定此为两因素影响试验资料。A因素为分组因素，B因素为剂量因素。整体分析：为两因素析因方差分析。统计结果两个因素的各水平整体间，有显著性意义（P＜0.05），两因素的交互作用也有统计学意义（P＜0.05）精细比较并结合数据来看： 通过有创肺功能仪检测各组小鼠的基础气道阻力以及激发时气道阻力，发现各组小鼠的基础气道阻力无显著差异，我们分别用0、3.125、6.25、12.5mg/ml四种乙酰甲胆碱浓度对小鼠的气道反应进行激发，发现当乙酰甲胆碱以3.125mg/ml的浓度激发时，各组小鼠的基础气道阻力无显著差异，而当乙酰甲胆碱以6.25、12.5mg/ml的浓度激发时，哮喘模型组小鼠的气道阻力较正常组小鼠显著升高，而氨茶碱治疗组以及地塞米松阳性对照组较哮喘模型组小鼠的气道阻力均显著降低，详细统计比较结果见表1，图1。评点：文字：依然是3个内容组成：整体分析，精细比较，结合数据的解析。当然，组合可以灵活，文字风格也可以多变，只要3个内容都不缺就行。表格：同前两因素重复测量所述，不再赘述。图形：需要多说的就是：两因素析因方差分析，一般建议带个交互作用图。
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抱歉，偶想知道的是怎么用Graphpad一步步地做。
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两因素析因方差分析 【例】 2.1 各组小鼠气道反应性的测定此为两因素影响试验资料。A因素为分组因素，B因素为剂量因素。整体分析：为两因素析因方差分析。统计结果两个因素的各水平整体间，有显著性意义（P＜0.05），两因素的交互作用也有统计学意义（P＜0.05）精细比较并结合数据来看： 通过有创肺功能仪检测各组小鼠的基础气道阻力以及激发时气道阻力，发现各组小鼠的基础气道阻力无显著差异，我们分别用0、3.125、6.25、12.5mg/ml四种乙酰甲胆碱浓度对小鼠的气道反应进行激发，发现当乙酰甲胆碱以3.125mg/ml的浓度激发时，各组小鼠的基础气道阻力无显著差异，而当乙酰甲胆碱以6.25、12.5mg/ml的浓度激发时，哮喘模型组小鼠的气道阻力较正常组小鼠显著升高，而氨茶碱治疗组以及地塞米松阳性对照组较哮喘模型组小鼠的气道阻力均显著降低，详细统计比较结果见表1，图1。评点：文字：依然是3个内容组成：整体分析，精细比较，结合数据的解析。当然，组合可以灵活，文字风格也可以多变，只要3个内容都不缺就行。表格：同前两因素重复测量所述，不再赘述。图形：需要多说的就是：两因素析因方差分析，一般建议带个交互作用图。 请问老师这个交互作用图是必须放到论文里头？用spss画的么？graphpad 能不能画？
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timeanddoctor Graphpad，发现A,B两因素均由影响，但是交互作用没有影响Source of Variation% of total variationP valueP value summarySignificant?Interaction2.3820.0725nsNoRow Factor44.93& 0.0001****YesColumn Factor2.1240.0307*Yes是不是就不用画交互图了，当然还是想请较交互图如何画，另外想请问，两两比较如何来做，我的统计结果没有显示呢？可画可不画，不强求的
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伽利略 山水约定 给你一个例样：3.6
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我也仔细算了，A与B的确反了。那请问你prism那里数据怎么排列？伽利略 山水老师，你好，这里例子让我很受益，有个地方。我没看明白，关于均值，我算的和你的结果不一致。我不知道是哪里理解错了。比如A4均值，你这里写3.83，但是1.73 2.25 2.47 3.31四个数的均值并不是3.83，而是2.44，是否表格里AB均值都写反了？A写成B，B写成A了？
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