TCGA中的miRNA是mirna前体序列还是成体

戚益军研究组在Nature Plants发表论文报道Elongator复合体在偶联miRNA前体的转录和加工过程中的重要作用
日,戚益军研究组在Nature Plants发表题为“Transcription and processing of primary microRNAs are coupled by Elongator complex in Arabidopsis”的研究论文。该论文报道了Elongator复合体参与拟南芥miRNA产生过程的分子机制,揭示了植物中miRNA前体的转录和加工是一个偶联过程,而Elongator复合体在该偶联过程中起到媒介作用。
miRNA是一类长约21个核苷酸的内源小RNA,它们可与Argonaute家族蛋白结合形成效应复合体,通过切割靶标mRNA或抑制其翻译调节基因表达。miRNA的产生主要包括两个步骤:1)在MIRNA基因位点由Pol II转录出其前体(primary miRNA, pri-miRNA);2)pri-miRNA被Dicer-like 1 (DCL1)加工形成成熟的miRNA。戚益军研究组利用正向遗传筛选方法,发现在真核生物中高度保守的Elongator复合体同时参与miRNA的转录和加工。他们的研究表明,拟南芥中Elongator的缺失会导致pri-miRNA转录水平的下降;同时,Elongator可与pri-miRNA加工复合体相互作用,并影响复合体中核心蛋白DCL1的正确定位。进一步研究发现,pri-miRNA和DCL1都富集于MIRNA基因位点的染色质上,并且DCL1与染色质的相互作用依赖于Elongator和pri-miRNA的存在。这些研究结果意味着植物中pri-miRNA的转录和加工是偶联的,而Elongator很可能作为偶联的桥梁,使pri-miRNA的加工更加高效、有序。同期Nature Plants 在“News & Views”中对该发现发表了评论文章。
清华大学生命学院博士后方晓峰为该论文的第一作者,其他作者包括博士生崔雨薇和李瑶曦等。戚益军教授为该论文的通讯作者。该研究获得了清华-北大生命科学联合中心、科技部和国家自然科学基金委的经费支持。
相关论文链接:
您是网站第42254位访问者,欢迎来访!miRNA前体克隆系列 | Cell Biolabs, Inc.更多公众号:zuoguishengwu公司秉承“立足基因科技,传播健康理念,服务大众健康”的企业文化推动基因组时代的发展,推动个性化诊疗技术及转化医学的全面开展。力将左归生物打造成基因分子诊断技术服务的一流企业,造福人类回报社会。最新文章相关作者文章搜狗:感谢您阅读外泌体中的miRNA,助纣为虐 本文版权归原作者所有,本文由网友投递产生,如有侵权请联系 ,会第一时间为您处理删除。关注今日:47 | 主题:308999
微信扫一扫
扫一扫,下载丁香园 App
即送15丁当
TCGA中的前体hsa-mir如何对应成熟miRNA
页码直达:
目前正在做关于miRNA-mRNA调控网络的研究,用到的数据有TCGA中的miRNA和mRNA表达数据,以及由mirBase等数据库中得到的miRNA-mRNA作用对,可是TCGA中的miRNA大部分都是前体hsa-mir,如hsa-let-7a-1
hsa-let-7a-2 , hsa-let-7a-3 , hsa-let-7b , hsa-let-7c , hsa-let-7d
,hsa-let-7e,hsa-mir-1-1 ,hsa-mir-1-2 ,hsa-mir-100 ,hsa-mir-101-1 ,hsa-mir-101-2 等, 而miRNA-mRNA作用对中的miRNA都是成熟体,hsa-let-7a-2-3p
hsa-let-7a-3p
hsa-let-7a-5p
hsa-let-7b-3p
hsa-let-7b-5p,hsa-miR-100-3p ,hsa-miR-100-5p
,hsa-miR-101-3p
,hsa-miR-101-5p ,hsa-miR-103a-2-5p ,hsa-miR-103a-3p等 ,那么TCGA中的前体hsa-mir如何对应成熟hsa-miR?
急求大神们指教
不知道邀请谁?试试他们
微信扫一扫
广告宣传推广
政治敏感、违法虚假信息
恶意灌水、重复发帖
违规侵权、站友争执
附件异常、链接失效
关于丁香园}

我要回帖

更多关于 外泌体mirna 的文章

更多推荐

版权声明:文章内容来源于网络,版权归原作者所有,如有侵权请点击这里与我们联系,我们将及时删除。

点击添加站长微信