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第九章 内膜系统与蛋白质分选和膜运输
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土豆系列0844
蛋白质的结构层次：一级结构、二级结构、超二级结构、结构域、三级结构、四级结构..
1、一级结构：即蛋白质的共价结构或平面结构,核心内容就是aa的排列顺序,它的改变涉及到蛋白质共价键的破坏和重建.
一级结构的全部内容包括：肽链的个数、aa的顺序、二硫键的位置、非aa成分.
2、二级结构的定义：肽链主干在空间的走向.主干指的是肽平面与α-C构成的链子,
2.1二级结构的内容：空间走向以及维持这种走向的力量：氢键和R基团的影响（离子键、疏水键、空间障碍等）
2.2二级结构的描述：ф角：肽平面绕N-Cα单键旋转的角度
ψ角：肽平面绕Cα-C羧基单键旋转的角度,至于+-方向的规定,0度角的规定太复杂,不作要求.这样,一个肽平面的空间位置可以被2个二面角来确定,如果每个肽链的两个二面角（ф,ψ）都相同,则构成了规则的空间走向,所以可以用（ф,ψ）来描述肽链的二级结构.
3、超二级结构：空间相邻的几个2级结构形成的更复杂的结构,其类型有：
1、左手超螺旋：3根α-右手螺旋拧到一起形成一个左手超螺旋,如头发中的角蛋白,
2、右手超螺旋：3根左手螺旋拧到一起形成一个右手超螺旋,如胶原蛋白,
3、αα：相邻的2根α-右手螺旋拧到一起形成一个左手超螺旋,
4、β×β：一个连接链连着2个β折叠,平行式,这个连接链可以很长.
5、βαβ：3段β折叠和2段α螺旋相间形成,
6、βββ：以2段U-型回折连接着的3段β折叠,反平行式.
4.、结构域：长肽链（多于150个aa）,在二级结构的基础上通过多次折叠,在空间上形成一些半独立的球状结构,叫结构域,它是三级结构的一部分,结构域之间靠无规卷曲连接.也就是说将三级结构拆开后首先看到的结构..
5、三级结构：即蛋白质的三维结构、构象,指其中所有原子的空间排布,是结构域再经过卷曲和折叠后形成的.如果蛋白质是单条肽链,则三级结构就是它的最高级结构,三级结构由二硫键和次级键（氢键、疏水键、离子键、范德华力）维持.P99是肌红蛋白的三级结构.
6、四级结构：多条肽链通过非共价键（氢键、疏水键、离子键、范德华力）形成的聚合体的结构就是四级结构,注意,由二硫键连接的几条肽链不具有四级结构.每条肽链都有自己的三级结构,称为亚基或亚单位,一般情况下,具有四级结构的蛋白质含有的肽链不会太多,故称这类蛋白质为寡聚蛋白,如寡聚酶等.
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http://222.30.32.3/course/swhx/04skja/lcf_01.pdf 这里讲得很详细，还画了图。
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