如何评价免疫治疗疗效评价组库测序的韩健

介绍免疫组库高通量测序分析软件(免费)
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|个人分类:|系统分类:|关键词:软件 免疫组库高通量测 多重PCR
尽管我们投入了几百万美金开发免疫组库扩增技术和分析软件,可是(从IT行业学来的)最佳的技术推广措施就是让大家免费使用。访问这个连接,, 然后用“demo"(小写)做为用户名,“12345"为password, 就可以进入我们免疫组库数据分析软件:进入网站后导航按钮在左手边,点击进入不同的数据库:进入数据库以后可以看2D, 3D 的V(D)J分布图,也可以看所有的CDR3序列,数据库内(你个人帐号内)不同标本分享的CDR3序列。二维图,CDR3清单都可以点击进入更详细的序列:分析软件还包括D50值的计算(定量分析免疫组库多样性的水平),V, J基因使用频率,V,J基因Triming的频率,CDR3片段长度分布,n addition随机插入的频率等科学家普遍关心的统计数据的计算。免疫组库技术是过去二十年免疫学,分子生物学,和信息技术发展的汇集成果。没有单克隆抗体技术,没有流式细胞仪等技术就不能对免疫细胞详细分类;没有PCR技术,技术(多重PCR),和高通量测序技术,免疫组库分析也是不可能的;还有,如果没有信息产业的发展,没有高速计算机,便宜的储存,快速方便的网络,和各种软件包,这些测出来的数据根本就没有办法看!以前写过一些有关的文章,其实IT行业已经给我们做出了很好的榜样。Google, Facebook, eBay,等公司能势如破竹地进入市场,靠的就是“免费使用”这个绝招。把产品做好,再好些,然后用最低的价格(甚至免费)推出,这样用户使用就没有顾虑了。没有什么能比“不要钱的好东西”更能让用户满意的了。同时,免费还是最让竞争对手头痛的事情。不过,免费的前提是使用我们的arm-PCR扩增技术和引物。去年我们刚推出技术服务的时候价格还很贵:用户提供RNA, 我们负责扩增VDJ, 测序,和数据分析。价格分别是$1000/标本(扩增建库),$18,000测序(454,外包),$5000数据分析。现在,我们在提供服务的同时也提供产品:扩增建库$50/标本,测序另计,数据分析免费。一年内把高端技术做成一般科研人员都能用得上,可见我们付出的辛劳和汗水,还有大笔的资金投入,我们没有用风投,也没有等政府投资,就是天使投资,包括我太太这个美丽的天使。
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Copyright &免疫组库测序还很贵吗?
今天发了一个电邮广告,向大概一千名免疫学家介绍免疫组库测序技术,标题是:Next generation sequencing of
immune repertoire: Is it affordable? (点图去链接)
我给大家算了笔帐,平均每研究一个标本的免疫组库大概是三百五十美金。听起来很贵,可是和得到的数据比起来,就显得便宜了:三百五十美金得到五百万条T或者B细胞受体的分子序列,每条分子读到一百到一百五十个碱基。相当于每块美金得到一百七十万个碱基的序列!
至于是否值得,就看科学家自己的假设是否有价值了。
前天我们还发出了另一个群发电邮,是介绍技术的。
介绍如果做免疫组库测序,是用基因组DNA做模板好,还是用RNA好。这实际是一个很重要的问题。
和测序所能解答的问题比较,这个技术已经不贵了。只是许多科学家还“问不起”这样的问题。这和许多技术的研发一样,都是一些手头有“空钱”的人先做。也就是我以前说过的,。能玩得起新技术的人,多半是一个领域的领先者,他们经费充足,能承受更多的风险。而这些人之所以领先,也正是因为在他们年轻力壮的时候“赌”了一把,冒了一个险。
安稳的职业发展道路是大多数人的选择,可是在按步就班的发展道路上,竞争对手如云,出头很难。有算计地冒险,把承担的风险缩到最小,把可能的回报争取到最大,这就是竞争之道。
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以上网友发言只代表其个人观点,不代表新浪网的观点或立场。GenomeWeb有关免疫组库的报道
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|个人分类:|系统分类:|关键词:生物技术 创新 创业
前两天,基因组科研方面的专业网站GenomeWeb 又有一篇文章报道了有关高通量测序在免疫组库方面应用。这篇报道的pdf文献可以。记者Monica花了不少时间,把这篇报道有关我们技术部分写得很详细。尤其是涉及到的一些技术细节,比如强调扩增反应的敏感性,包容性,和半定量能力等。虽然现在市场上已经有做这个项目,可是我们的技术特点和长处也还是很明显的:
半定量,高敏感地扩增免疫组库。
引物设计考虑到减少Hypermutation和deletion带来的假阴性。
全自动技术平台,使用方便。
产品完全,有人和鼠,DNA/RNA, T&B 细胞,454和Illumina。
最早申请了专利保护,有多项IP.
因为我们有产业化的经验,所以在技术开发的初始阶段就考虑到将来在市场上可能碰到的要求和阻碍。比如说产品全面,质量保证,使用方便,服务好,信息精简而全面等等。前两天接到科学网的一个记者约稿,希望我谈谈技术转化有关的问题。这其实我以前没有少写,就是没有在一篇文章里面。这也是写博客的特点,想到那里就写到那里。技术转化的问题实际上包括&转什么?&和&怎么转?&两个问题。第一个问题是技术成果是否有商业价值?这个价值如何体现?如何衡量?而第二个问题是涉及的则是买卖双方的谈判问题。谁买,谁卖?我的经验是自己把有价值的科技成果直接拿来做产业化,没有太多的&转手&交易,直到把技术的最大价值充分体现出来的时候在去&转化&。所以,创业也是技术转化的一个模式,可能也是最难,回报最高的模式。
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