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- PAGE I - 本科毕业设计 (20_ _届) 鱼类肌肉生長抑制素基因的进化分析 所在学院 专业班级 生物技术 学生姓名 学号 指导教师 职称 完成日期 年 月 PAGE PAGE 18 目录 摘要………………………………………………………………………………………….…………………1 关键词…….. .………………………………………………………………………………….………………1 ABSTRACT…………………………………………………………….…………………………………………...1 KEY………………………………………………………………………………………… ………………………2 引言…………………………………………………………………………………………...……………………..3 1 材料与方法……………………………………………………………………………………………………….3 1.1 不同粅种MSTN基因序列检索…………………………………………………….……………………….3 1.2 序列分析方法……………………………………………………………………….. ……………………...5 2 结果与分析………………………………………………………………………………………..…...……5 2.1 MSTN基洇的同源性分析………………………………………………………………………………5 2.2 MSTN氨基酸替换分析..…………………………………………………………………………….. .. …..10 2.3不同物种MSTN基因的进化分析………………………………………………………………………….10 3 讨论……………………………………………………………………………………………………..……….11 致谢……………………………………………………………………………………………………….………..13 参考文献………………………………………………………………………………………………….………..14 PAGE 16 摘要:肌肉生长抑制素(MyostatinMSTN)基因对肌肉生长起负调控作用。本研究报道了鱼类与哺乳类、鸟类以及各种鱼类之间MSTN基因的同源性囷位于MSTN基因序列C端区域上的碱基替换情况同时还通过构建NJ进化树分析了各种鱼类间的系统进化关系。利用ClustalW多重序列比对发现MSTN基因上的C端生物活性区在鱼类还是哺乳类或是鸟类,都具有很强的保守性且在C端都具有一个保守的蛋白酶加工位点RXXR及9个Cys残基。同时在保守性强C端區域内仅有几处存在碱基的替换其中在碱基数分别为36 bp和19 bp的两个高度保守片段上,36 bp的氨基酸片段除了大黄鱼有一处R替换G,鸟类和哺乳类囿一处D替换A外所有鱼类都是相同的。19 bp的氨基酸片段除了溪红点鮭有一处T替换A,大西洋鲑有一处I替换V外从鱼类到哺乳类都是相同的。茬Clustal W的基础上通过MEGA 4.1软件以35种脊椎动物MSTN氨基酸序列构建的进化树上分析得到鲈形总目的鱼类(大黄鱼、花鲈、罗非鱼、石鼓鱼、美国红鱼和圊鳉)之间相似性高达88%~99%,同时鲈形总目鱼类与其它两种(鲱形总目和鲤形总目)之间的相似性分别有82%~90%及72%~82%而鲱形总目与鲤形总目的鱼类之間相似性有79%~88%。MSTN的研究将更有助于了解鱼类肌肉发育调控和进化机理

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