首先说一下情况,我有16个samples10个粅种变量(species,某些基因的含量)我将温度,群落结构(各种微生物的丰度)和重金属作为环境变量(environmental variables)总共141个环境变量,因为是想要了解环境变量和物种变量之间的关系我选用了进行约束性排序RDA进行分析,结果就出现了下图的提示
QQ图片55.jpg 然后点击继续就进行了非约束性排序PCA分析了这跟我的初衷就不一样了,得出的结果也无法进行解释就像下图
1.png 我想了解为什么会出现这种情况,有没有大神帮忙解释一下当嘫后来我解决了,但是进行的是PCA with supplementary variables就是将环境变量作为补充的解释变量进行的非约束性PCA分析,这样就得到了自己的结果
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