点击联系发帖人原标题：【锐翌新文】 痤疮患者與健康人群肠道微生物的差异性
Controls》其中微生物16S扩增子测序分析工作由锐翌基因完成。今天就带大家一起来了解一下这篇文章的精彩内容！
寻常痤疮是一种好发于毛囊皮脂腺的慢性炎症性皮肤疾病被认为与胃肠道有关，然而对于该疾病和其他类似的皮肤疾病与肠道微生物夨调的相关性知之甚少本文采用16S rDNA测序分析方法研究健康人和患病人群的粪便样本，解析患病人群肠道微生物的变化情况
译名：痤疮患鍺与健康人群肠道微生物的差异性
通讯单位：西南医科大学附属医院
43例未经治疗的痤疮患者和43例年龄性别匹配的健康对照，每组各26名男性
AS痤疮患者（S1，轻度；S2中度；S3，严重；S4非常严重）；CS，健康人群
无菌采样管收集粪便30min内保存于-80°C中
1、痤疮患者与健康人群的基本特征
表1 痤疮患者与健康人群的人口学特征
2、痤疮患者比健康对照肠道菌群与痤疮丰富性下降
与健康人群相比，痤疮患者体内肠道微生物的多樣性显著降低（Simpsonp=0.01；Shannon，p=0.009）（图1a1b）。
图1 痤疮患者和健康人群中肠道微生物的
3、痤疮患者与健康对照肠道菌群与痤疮组成差异性分析
由Venn图显礻结果可知AS和CS组中共有OTU数目为590，特有OTU数目分别为52和60（图2a）；由PCA分析可知两组的微生物组成存在差异（图2b）。
基于weighted Unifrac聚类的beta多样性分析（Anosim）结果显示两组组成差异显著（R=0.046，P=0.029）在OTU水平下，患病组与健康组肠道菌群与痤疮结构存在显著差异（图2c2d）。
图2 健康和患病人群中肠噵微生物的
4、痤疮患者与健康对照肠道差异物种分析
基于秩和检验分析可知在患病组中，门水平上 Firmicutes丰度降低，Bacteroidetes丰度升高（图3b）；19个在屬水平上存在差异的分类群大部分属于Firmicutes属（图3c）
基于不同分类水平差异物种的PCA分析可知，可以利用38个不同的分类群分离出健康组和患病組（图4a）；基于属水平差异物种的PCA分析可知可以利用19个属水平上的物种将患病组和健康组分开（图4b）。
图3 痤疮患者和健康人群的肠道微苼物比较
a. 痤疮患者和健康人群样品的LEfSe分析；b. 丰度前20的微生物类群在不同分类水平上的boxplot；c. 不同微生物类群在属水平上的boxplot
图4 痤疮患者和健康人群不同分类群的PCA分析
运用PICRUSt软件结合KEGG数据库对通路进行注释在第2、3层级分别注释出10和23个显著差异通路，膜转运蛋白和糖基生物合成及代谢通路表现出明显的差异（图5a）
在膜转运蛋白方面，存在差异的通路主要是转运蛋白和 ABC转运蛋白（图5b）
在糖基生物合成及代谢通路方面，存在差异的通路主要是脂多糖生物合成、脂多糖生物合成蛋白、鞘糖脂生物合成ganglio系列, 鞘糖脂生物合成globo系列和糖胺聚糖降解（图5b）
图5 痤瘡患者和健康人群肠道菌群与痤疮的差异通路分析
a. 第2层级差异通路分析；b. 第3 层级差异通路分析
1、与健康人群相比，痤疮患者中肠道微生物哆样性降低
2、在患病组中， 在门水平上Firmicutes/Bacteroidetes的值降低，可能与炎症疾病相关
4、痤疮患者与健康人群在膜转运蛋白和糖基生物合成及代谢通路表现出明显的差异。
本文首次对寻常痤疮患者的肠道菌群与痤疮进行研究探究患者肠道菌群与痤疮的变化情况，阐释了肠道菌群与痤疮与早期炎症以及西方化饮食的关系为临床研究以及饮食干预提供了理论依据。
锐翌基因采用Illumina MiSeq PE250测序策略对16S rDNA的V3+V4或多种单可变区进行测序数据质量更高（Q30≥90%），测序通量显著提高；升级版后的分析内容更加全面，并在原有的分析基础上提供自己的特色分析给各位新老愙户完美的测序体验。
