如何搜索特定物种的某基因序列想搜索兰科植物的查尔酮合酶（CHS）基因,在NCBI上能搜索到CHS基因但不知道怎么找兰科的CHS基因,
列出一些你感兴趣的兰科植物的拉丁名称,在搜索是使用“拉丁学名+基因名称”的搜索方式就可以得到你需要的相关信息.
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到这几个网站去看看：基因与发展基因组研究基因组生命科学
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本帖最后由 细胞海洋 于
00:41 编辑
我很少涉及分子的东西，请教高手，如何从ncbi上找该启动子序列？？？我找了，似乎都不对
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可以克隆+1前述的1000bp
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利用Map viewer查找启动子（Promoter）
一、打开Map viewer页面，网址为：) v6 z, e) O+ T+ z
在search的下拉菜单里选择物种，for后面填写你的目的基因。8 f. d, @% {" L3 X/ ^
二、点击“GO”
三、在步骤二的右下角有一个Quick Filter,下面是让你选择的几个复选框，在Gene前面的小方框里打勾，然后点击Filter.
四、点击reference对应的&Genes seq&，出现新的页面3 I9 v$ u1 I: ^5 R: n8 S
五、点击出现的“Download/View Sequence/Evidence ”，即下载查看序列等功能
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你的热心，成就卓越。
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1000bp的话是不是有点短啊，有的时候看文献，貌似还要更往前一点，是不是不同的基因不一样啊。
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用ensembl，很方便的
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这是个Transcriptional Regulatory Element Database。
里面可以按照基因名称搜索到每个基因的启动子序列。% Q% l$ x- |) z7 W7 W" k
但是也是按照通用准则，即基因前面bp来认定的。
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ncbi上的转录起始位点都是机器预测的，不一定准，一般要参考一些以前做过目的基因转录调控的文献来确定一下比较可靠，如果转录起始位点的位置确定了，那么启动子一般应该在-1000以内，置于调控区就不好确定了，甚至可能出现在-30k或是3‘utr的后面。
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你看看这个网站，专门设置启动子
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ok 谈谈我的经验 最初作为菜鸟 我是直接从NCBI上直接下载启动子序列的 不过这个时候一定要注意 一是你的基因是反向编码 还是正向编码的 新手容易搞错的 然后就是启动子序列的选择 一般前2000bp足够了 5000bp同样可以 只是在序列选择那个地方多减去你要的长度而已；二是并不是所有物种都好使的，所以你要就human 或者mouse一般没有问题；三是注意修改显示片段长度后，一定要确认显示的正确与否，因为有时候NCBI的序列没有改变。+ {+ j: f4 v7 e9 [2 E. S&&_2 A3 Y+ Y
当然现在有不同的网站也可以供你下载启动子序列，楼上的几位已经详细说了 不累述。
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Powered by不知道的肯定以为是影视学院的学生在拍戏呢。
新郎的衣服已经被撕开，双脚也被透明胶带捆住了。
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　　表观遗传学是近几年生物学研究进展最为迅速的一门学科。而DNA甲基化作为表观遗传学最热门的研究方向，进展速度甚为惊人。
　　从绘制单碱基精度的人类DNA甲基化图谱到发现CpG岛海滩现象，再到植物中去甲基化调控机制的研究，研究者对DNA甲基化的关注度不断增加。如何更好地利用这些技术手段，应用于自己的个性化研究，是每个科研工作者最为关心的问题。很多老师虽然对此极感兴趣，却感觉有点无从下手。
　　通常大部分研究都集中在基因的启动子区，那么如何查询基因的启动子序列呢？
　　首先，打开NCBI官网：http://www.ncbi.nlm.nih.gov/
　　然后在搜索框中找到“gene”,并输入想要查找的基因号，例如（at1g11180）,然后“search”
　　在搜索结果中，找到如下图中的“MapViewer”，查看基因在染色体中的位置
　　下一步的结果就能够查看该基因的位置，还有很多其他的信息，找到右下角的
　　你可以查看到三种形式的序列：Graphics 、FASTA和GenBank，推荐使用后者，因为可以看到对序列的注释，可以清楚的看到哪是基因，哪是启动子，哪是CDS等。点击“GenBank”查看；
　　由下图可以看出，该基因序列范围：，mRNA范围： (,,,,,)，CDS范围： (,,,, ,)，基因中的外显子不是连续的，因此CDS也不是连续的；
　　CDS上游的序列就是该基因启动子部分，而具体的启动子的长度是不一样的，可以根据需要进行选择。如果觉得上游的序列不够长，可以在右上角设定显示的碱基的范围，从而获得足够长度的序列（通常我们选择上游2kb区域）；
　　值得注意的是，该基因编码方向为→
　　如果是上图蓝色框中右边方向←，则选择序列下游2kb序列。
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怎样在NCBI中查找一物种的全基因组？
做虫虫的，也不知道这个有没有全基因组序列，但是不知道在哪儿查？求高人指点，谢谢啦！
谢谢，我这样就得到了500多条结果，各种基因的，我想知道的是，这个物种的全基因组是否有人公布，这个怎么看啊？
我查的是昆虫，在国外早就被研究的和清楚了，但是数据库没有，你知道其他可以查全基因组的数据库吗？谢谢啦。
谢谢，按照你的方法找，没有结果，那可能就是我那个物质还没有公布吧？
舞毒蛾，有听说么？
哇，谢谢啦，搞清楚啦~
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