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柱压与硅胶基质的形态（如无定形或球形硅胶）、颗粒大小、填料合成条件、装柱条件、所用流动相和分析时的温度有关。不同厂家的色谱柱柱压会有所差别，相同流动相和温度的条件下，不同厂家新色谱柱有的柱压可能相差4、5个MPa，这是由厂家所选用的硅胶基质及其生产条件决定的，这种差异的存在是正常的。同时需要说明一点，柱压与柱效有一定的关系，通常柱效高的色谱柱柱压相对而言会高一点，但柱压高的色谱柱并不一定就具有高柱效。在色谱柱的使用过程中柱压通常会出现两种升高的形式：第一种是，随着使用时间的延长色谱柱柱压慢慢上升，这是正常的；第二种是，使用过程中（流动相和温度没有改变的条件下）色谱柱压力突然升高很多。这种压力突然升高的现象，通常由于使用不当引起的，原因： 1）样品太脏，使用前没有过滤，导致柱筛板堵塞。2）样品含有的杂质在流动相中的溶解性不是很好，与流动相混合后析出，导致柱塞板堵塞。解决办法：将柱子反接，反冲柱子，如果压力有明显缓慢下降，则说明柱头阻塞，用pH=1稀磷酸及甲醇冲洗，有时能解决问题。正接色谱柱后，压力还是缓慢上升，则拆开柱子，清洗柱子的过滤筛板，用25%HNO3超声清洗（或更换筛板）。如柱头很脏，刮去部分填料，用相同或相近的填料补上，很多情况下能解决问题。注意：压力升高有时是检测器阻塞造成的，拆下色谱柱，直接将进样阀与检测器相连，看看压力变化，同时检查连接管的通畅性。
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