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径向分布函数解析
我做盐水溶液的经典分子动力学模拟，在分析径向分布函数时遇到一些问题，向大家求助
1、径向分布图中g(r)的量纲是什么？g(r)最高峰的高度代表什么意思？不同的体系可以通过比较峰的高度来说明相互作用的强弱吗？
2、两个溶液的个g(r)图进行比较时，在第一壳层中，A线峰的高度比B线高，但是相应的配位数却是B线对应的体系的大，着怎样解释？
谢谢:hand:
可以通过不同径向分布的峰高比较两种相互作用强度大小吗？
两条径向分布曲线中其中一条峰的高对比较高，但是相应的配位数却比第二条小，应该怎样理解？
两条径向分布曲线中其中一条峰的高对比较高，但是相应的配位数却比第二条小，应该怎样理解？
径向分布.gif
我不是刚说过吗？配位数是看面积的，不是峰高决定的。
嗯，我的意思是有时候峰高度很大，但是配位数却相应比较小，就像图中那条黑色的线，峰高是最高的但是对应第一壳层的配位数却是最小的，这两者之间出现这样的情况并不矛盾吗？
哦，原来你这是不同原子分数的体系来比较，Cl原子的数密度不一样。你看一下配位数计算的公式就明白了，公式里除了面积以外，还有个系数。
你好，想请教一下，我做表面吸附的想得到吸附分子中的某一原子比如（C）与吸附表面之间的径向分布 函数，怎么set？谢谢
这个不能单纯set就能实现吧，一个原子到一个平面的垂直距离，得编写脚本，我不会啊
您好，我做RDF的时候发现改变Interval的值，径向分布函数峰值也会有变化，这是为什么呢？一个晶胞的配位数是个定值吗？
峰值变化了多少呢？你的Interval又改变了多少呢？
不好意思啊，没有讲清楚。。。。Interval从0.05改成0.2，峰值从7变到了5.5
你interval变到0.2nm，点的间隔就是0.2nm，峰说不定在0.1到0.3之间了，就不显示了
您好！图上是我计算的径向分布函数，我做的是水与金属氧化物表面的相互作用，图是选择所有水中的H原子与金属氧化物中所有氧原子分析出来的径向分布函数，这个正常嘛，水分子有1240个，峰值特别小，而且峰特别多，不知道怎么分析，求指点一二，万分感谢:)
QQ截图19.jpg
请问这个现在会分析了吗？溶液中原子比较混乱，会出现峰低而多的情况，请问，你的这个图能说明说明情况？能反映H与金属氧化物中O的相互作用吗？
我重新算了，下图 分子数确实比较乱的，还是不怎么好
QQ截图22.jpg
你好！我想问一下，你的径向分布函数做归一化处理了吗？为什么我的峰值很大？？
2_30atm.gif
你好！我做的径向分布函数峰值很高？怎么进行归一化处理啊？谢谢指教
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径向分布函数D（r）的概念及讨论小木虫 --- 500万硕博科研人员喜爱的学术科研平台
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关于径向分布函数的分析
如图05、06是计算得到的两个径向分布函数图，怎么有好多峰，该怎么解释分析，还有最后为什么不是区域一个定值，如果是趋于一个定值，可以说明什么。下面是从其它帖子里贴出来的所以就不要再讲其它的基本知识，最好针对这个图说一下吧，谢谢了！:)
径向分布函数rdf是从一个原子出发, x轴表示离开这个原子的距离，y轴表示在某个距离上出现原子的个数或者可能性。
极端的情况是气体和理想晶体：
1. 如果是气体的话，RDF是一条水平的直线，因为气体分子或者原子是无序分布的，从某个原子出发，任何一个距离上都可能有原子。所以各个位置是等价的。
2. 如果是理想晶体，原子是彻底有序分布的，每个原子的位置是固定的。好比理想的BCC： 从某一个原子出发，到最近的相邻原子的最小距离是 sqrt(2)/2 *a。 以初始原子为球心，画一个半径为 sqrt(2)/2 *a的球，这个球
内部除了初始原子没有任何原子，所以在rdf的X轴 0 & r & sqrt(2)/2 *a 距离内 y 等于 0， 而球面上有8个原子，因为配位数等于8， 所以在x=sqrt(2)/2 *a的位置上y 等于 8，一条和x轴垂直的线段高度等于8。 到了第二相邻原子的位置，对bcc来说距离是 a/2，一共6个原子， 那么在 x=a/2 的地方一条于x轴垂直的线段高度等于6，而在
sqrt(2)/2 *a & r & a/2 的距离内没有原子 y=0 , 以此类推，第三第四 ...
那么为什么你测出的是峰不是某一点和x垂直的线段呢，因为你有温度，原子在活动，你测量的那个点原子可能刚好偏离平衡位置， 对bcc来说，第一相邻原子不会刚好在 sqrt(2)/2 *a 的位置，由于热运动稍微有点偏离，所以峰值会降低，宽度会变大，出现了峰的形状， 随着你温度的升高，原子热运动越来越厉害，离开平衡位置越来越远，峰高度会越来越小，峰会越来越宽， 液化了以后变成短程有序，很小的峰高，很宽的峰， 气化了以后完全无序了，就变成类似水平的直线。
是啊 我也疑惑 不过文献里计算得到的也没趋于1 但是是基本趋于一个定值0.9，是不是我算错了。
好的 第二点应该是靠谱的，文献中结果也是体系是各向异性的，MD之后由于受到表面的作用，体系也进行了重新分布，这样解释应该是比较靠谱的，受教了。另外是不是看距离的话就看第一个和第二个高峰就可以了？谢了:)
呵呵，惨愧！分析径向分布函数一般关注的是X轴的截距的意义：最短作用距离，或者是粒子的直径，第一峰值要解释，谷底的位置好像也有其物理意义，至于其他的位置见到的解释不太多。关键是你要想解释好RDF不能只看别人怎么说，还要真正的理解你所研究的体系，看看体系本身具有什么特性，然后我们模拟的数据都是这些本质特征的一个表像。个人认为：深刻理解模拟体系的本身有助于解释好这些模拟数据。
好的，万分感谢:D
您好，我用lammps计算rdf，但是x轴一直被限制在1nm，请问怎么扩大x轴的范围，有虫友说的力场文件里的cutoff限制，请问您了解吗
抱歉，我不了解这个软件，没用过。按你说的意思应该是在初始条件中调整X轴方向的区域宽度吧？
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随时随地聊科研径向密度函数图与径向分布函数有什么区别_百度知道径向分布函数,&(也叫做&对关联函数)&为相距参考粒子处粒子的密度。
对于均匀和各项同性体系，设参考粒子处于原点&O，粒子平均数密度为&，距离&O&&处局域时间平均密度为&。
&|&相关影像
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