itraq试剂盒说明书为什么会与赖氨酸侧链反应

安泰吉(北京)生物技术有限公司【Antagen(Beijing)BiotechnologiesCo.,Ltd.】是一家位于北京经济技术开发区内的高新技术企业,重点从事生物技术产品的研究开发、技术服务和科研工具试剂的开发..
应用类型1、适用于通过特定方法(免疫沉淀、Pull-down或其他材料)富集后的蛋白质样品;2、进行蛋白质相互作用、药物靶位筛选(小分子与蛋白质相互作用)等;3、进行蛋白质翻译后修饰鉴定与筛选..
iTRAQ/TMT定量蛋白质组学技术特色:(1)最先进的、进行疾病分子标志物筛选的定量蛋白质组学技术。对于拥有病理组织资源的客户,该技术极具优势;(2)该方法可以同时进行多达8组样品的分析;(..
详细描述定量蛋白质组学技术方案SILAC(StableIsotopeLabelingwithAminoacidsinCellculture)特色:(1)最先进的、进行细胞中蛋白质相互作用和差异表达蛋白质分析的定量蛋白质组学技术;(2)通..
n服务简介SILAC(stableisotopelabelingwithaminoacidincellculture)即细胞培养条件下稳定同位素标记技术。细胞用含有轻、中、重型同位素的必需氨基酸培养基培养,经过6代以上的培养,细胞内的..
n服务简介双向电泳是在第一向用等电聚焦将不同等电点的蛋白分离,在第二向用聚丙烯酰胺凝胶将不同分子量的蛋白再次分离的技术。凝胶经染色、成像后,用分析软件进行比对,可实现对蛋白的定量研..
 ITRAQ技术,全称“isobarictagsforrelativeandabsolutequantitation”,中文“等重标签标记用于蛋白质相对和绝对定量技术”,它是美国ABsciex公司研发的蛋白质组定量专利技术,已经成为一种越..
提供蛋白质晶体结晶条件筛选、优化、X-射线衍射、结构解析
提供蛋白质原核表达及后续纯化。
iTRAQ(Isobarictagforrelativeandabsolutequantitation)采用液质联用的方法高通量地检测多组别间的蛋白质表达差异。蛋白质酶切成多肽后,用iTRAQ同位素试剂标记多肽N末端或赖氨酸侧链基团。标记..
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简介:iTRAQ ( Isobaric tag for relative and absolute quantitation ) 是采用液质联用的方法高通量地检测多组别间的蛋白质表达差异。蛋白质酶切成多肽后,用iTRAQ同位素试剂标记多肽N末端或赖氨酸侧链基团。标记后的多肽经过液相色谱分离,进行一级和二级质谱分析,在二级质谱前,被标记的不同样本中的同一多肽表现为相同的荷质比和其它理化性质;在二级质谱中,多肽被破碎后产生不同的信号离子,信号离子表现为不同荷质比(113~119,121)的峰,根据波峰的高...
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iTRAQ定量蛋白质组学
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蛋白质定性定量分析(iTRAQ,Label-free)
发布时间: 15:37&|&
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一、iTRAQ技术简介
iTRAQ技术是由美国应用生物系统公司(Applied Biosystems Incorporation,ABI)2004年开发的同重标签标记的相对和绝对定量(isobaric tags for relative and absolute quantitation,iTRAQ)技术。
iTRAQ试剂是可与氨基(包括氨基酸N端及赖氨酸侧链氨基)连接的胺标记同重元素。在一级质谱图中,任何一种iTRAQ试剂标记不同样本中的同一蛋白质表现为相同的质荷比。在一级质谱中,不同来源的相同肽段表现为一个峰;在二级质谱中,iTRAQ试剂中的平衡基团发生中性丢失,信号离子表现为不同质荷比(114~121)的峰,因此根据波峰的高度及面积,可以得到同一蛋白在不同样本中的表达差异;同时,肽段的MS/MS结果结合数据库检索可以鉴定出相应的蛋白种类。 二、技术原理 报告部分共有8种:质量数分别为114~121Da,因此iTRAQ最多可同时标记8组样品(客户可按需选择标记个数)。肽反应部分:能与肽链N端及赖氨酸侧链发生共价连接,从而将报告部分和平衡部位标记到肽段上,几乎可以标记所有蛋白质。平衡部分:质量数分别为31~24Da,与报告部分相互配合,保证iTRAQ试剂标记的不同样本的同一肽段具有相同的质荷比。 三、实验流程 iTRAQ实验流程。
1:收集不同组别的样本并分别提取蛋白质;
2:蛋白质经过还原,封闭后用胰蛋白酶酶切;
3:各组样本的肽段混合物分别用不同的iTRAQ试剂标记;
4:等量混合各样本中的标记肽段;
5:MS/MS质谱检测及分析。 四、技术优势灵敏度高:可检测出低丰度蛋白;分离能力强:可分离出酸/碱性蛋白,小于10KD或大于200KD的蛋白、难溶性蛋白等;适用范围广:可以对任何类型的蛋白质进行鉴定,包括膜蛋白、核蛋白和胞外蛋白等。高通量:可同时对8个样本进行分析,特别适用于采用多种处理方式或来自多个处理时间的样本的差异蛋白分析;结果可靠:定性与定量同步进行,同时给出每一个组分的相对表达水平、分子量和丰富的结构信息;自动化程度高:液质连用,自动化操作,分析速度快,分离效果好。 五、信息分析o 数据产出统计o 蛋白质鉴定结果o 蛋白质定量结果o 蛋白质GO分析o 蛋白质COG分析o 蛋白质Pathway代谢通路分析o 差异蛋白GO富集分析o 差异蛋白的Pathway富集分析o 重复性分析(仅针对有重复设计的项目)o 多样品间表达模式聚类(适用于样本数≥3的项目也可以根据客户的要求进行个性化定制分析 六、样品准备1.蛋白运输:24小时内可以4度运输;2.蛋白长期保存:-20℃;3.待检测蛋白要求:蛋白量最低50ug,浓度最低要 为5ug/ul 10ul,否则同位素无法标记;4.蛋白提取试剂要求:使用普通的组织、细胞裂解液即可,切忌不要使用二维电泳试剂提取;5.直接提供组织或细胞。--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------一、Label-free技术简介
蛋白质非标记定量技术(label-free)是通过液质联用技术对蛋白质酶解肽段进行质谱分析,无需使用昂贵的稳定同位素标签做内部标准,只需分析大规模鉴定蛋白质时所产生的质谱数据,比较不同样品中相应肽段的信号强度,从而对肽段对应的蛋白质进行相对定量。Label-free的技术优势就在于蛋白质不需要进行标记,所需样品总量少,耗费低。 二、技术原理
非标记定量蛋白质组学已成为越来越重要的质谱定量方法,按照其原理主要分为两种:
Spectrum counts类的非标记定量方法:发展比较早,已经形成多种定量算法,但主要原理都是以MS2的鉴定结果为定量基础,各种方法的差别在于后期算法在大规模数据上的修正。
另一种非标记定量方法的原理是以MS1为基础,计算每个肽段的信号强度在LC-MS色谱上的面积积分。 三、实验流程 四、应用特点● 对液相色谱串联质谱的稳定性和重复性要求较高。 ●无需昂贵的同位素标签做内部标准,实验耗费低。 ●对样本的操作也最少,从而使其最接近原始状态,并且不受样品条件的限制,克服了标记定量技术在对多个样本进行定量方面的缺陷。
同位素标记
非同位素标记
样本标记同位素
样本非标记
样本量限制,ICAT(2),iTRAQ(8)等
样本无限制
在大样本过程中,难于跟踪蛋白丰度
易跟踪蛋白丰度
多数肽段难于识别
能够识别大多数肽段
难于识别和定量低丰度蛋白
能够鉴别低丰度肽段
需提前进行二级质谱蛋白鉴定
可以鉴定差异后再进行二级质谱蛋白鉴定
实验重现性高
实验重现性低
五、信息分析
差异基因列表
样本之间相关系数热图
上下调基因表
层次聚类热图
差异基因数目比较表
主成分分析图
上下调基因数目比较表
K-均值聚类图
鉴定蛋白理化性质表
GO功能富集图
K-均值聚类类别表
差异基因火山图
时间序列的相关系数表
差异基因的KEGG通路图
GO功能表(仅限于UNIPROT来源的库)
信号通路Mapping表
染色体定位图(若有染色体定位信息)
信息分析内容数据产出统计蛋白质鉴定结果蛋白质定量结果蛋白质GO分析蛋白质COG分析蛋白质Pathway代谢通路分析差异蛋白GO富集分析差异蛋白的Pathway富集分析重复性分析(仅针对有重复设计的项目)多样品间表达模式聚类(适用于样本数≥3的项目)定制化信息分析蛋白质组与转录组关联分析 六、样本要求
蛋白质提取物
浓度 &1μg/μl,蛋白质总量 &200μg
动物、微生物组织湿重&10mg;植物鲜嫩组织&100mg
血液体积&500μl
细胞量&10的7次方
北京青莲百奥生物科技有限公司,为您提供蛋白质定性定量分析服务:}

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