如何把heka的数据转化成clampfit软件下载

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【求助】膜片钳数据分析
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这个帖子发布于7年零289天前,其中的信息可能已发生改变或有所发展。
大家好:我所做的是全细胞记录海马和皮层锥体神经元EPSC和IPSC,放大器是HEKA的epc10。数据处理方法使用minianalysis,转化为clampfit可分析的ABF文件。使用clampfit9.0分析。下面是我遇到的问题:1.我的转换文件在clampfit界面中是以sweeps形式展现的,当我将波形连续显示,选择分析整个波形时,为什么只能分析第一个sweep(我记录的单个时长为60s)?如果超出60s,就会跳出内存错误的提示,之后软件自动关闭。2.破膜后怎样评判破膜的好坏,有几项指标可以参考?3.怎样判断破膜后细胞自动融合?看串联电阻还是别的?肯请高手指点,谢谢大家!
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转换和分析数据,我不太了解,因为多数人记录软件为clamp不需转换即可在mini analysis中分析。破膜后判断膜后细胞的好坏,主要是看:1 Ra (access resistance)的值是否稳定保持在20以下,波动范围较小2 记录到的电流比较稳定,如相隔2分钟给予同一激动剂记录到的电流值应该差别不大3 可以在显微镜下直接观察细胞的状态,看细胞有无明显肿胀、失去原来光亮的表面或由亮变暗,电极有无移位等总之,要综合考虑
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怎样判断破膜后细胞自动融合?看串联电阻还是别的?这个问题是这样的若膜自动自动融合,你会发现Ra值会由原来的小于20增大到20以上,甚至到60以上,记录到的电流的反应幅度也大幅减小总之在实验中要不停地进行seal test,全程监测Ra的变化
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非常感谢yangbni版主!
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yangbni 怎样判断破膜后细胞自动融合?看串联电阻还是别的?这个问题是这样的若膜自动自动融合,你会发现Ra值会由原来的小于20增大到20以上,甚至到60以上,记录到的电流的反应幅度也大幅减小总之在实验中要不停地进行seal test,全程监测Ra的变化问个问题,axon200B如何看Ra值,我知道在seal test里面可以看到Ra值,但是在文件记录过程中,就无法看到了啊。而且实验中不停的seal test 肯定会影响记录的啊?不知道我说的对吗?还希望版主明示,没办法,都是自学的。。。
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yangbni 怎样判断破膜后细胞自动融合?看串联电阻还是别的?这个问题是这样的若膜自动自动融合,你会发现Ra值会由原来的小于20增大到20以上,甚至到60以上,记录到的电流的反应幅度也大幅减小总之在实验中要不停地进行seal test,全程监测Ra的变化不需要用软件里的”seal test&,直接在自己纪录的protocal里加一段内向的电流(for current clamp)就可以检测Rin
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acchj 不需要用软件里的”seal test&,直接在自己纪录的protocal里加一段内向的电流(for current clamp)就可以检测Rin我记录的是mIPSC 或者mEPSC。实在电压钳下记录的,这时候怎么加内向电流?而且加了内向电流岂不是掩盖了我的电流?楼上的在北京吗?能否登门求救?现在每次多会一点点,发现不懂的就更加多很多。。。没人指导,真的就只靠dxy了各路神仙了。。。
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gongkege 问个问题,axon200B如何看Ra值,我知道在seal test里面可以看到Ra值,但是在文件记录过程中,就无法看到了啊。而且实验中不停的seal test 肯定会影响记录的啊?不知道我说的对吗?还希望版主明示,没办法,都是自学的。。。一个实验中应该会有多次记录,而seal test是在记录间隙进行 的,可以监测细胞的膜的开放情况,而具体Ra的值则可通过membrane test来直接读出,而且你在进行membrane test时,Cm, Rm, Ra, Tau等值会自动写到comment to lab book中去,在分析数据时你可随时读取,你可在system lab book 中找到实时滥测的上述各值。
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具体见下图
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读取Cm, Rm, Ra, Tau等值
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这些值会自动进入comment to lab book中去(因为没实验,所以此值无法读取,也就不显示)
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通常情况下实验中在实验间隙中进行seal test不会影响你的记录,这点请放心
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关于丁香园【求助】想问一下电生理方面的数据都如何处理 - 经验共享 - 分析测试百科网 - 分析测试百科网
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【求助】想问一下电生理方面的数据都如何处理
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我刚入学一个月,想问一下电生理方面的数据都如何处理?用什么软件?要用VB,MATLAB之类的编程吗?所有的电生理实验都要用吗?查看完整版本请点击这里:
mimima ( 11:12:11)
对于动作电位或自发性突触后电流(sEPSC/SIPSC)等还可用mini analysis进行分析,
放大器若为HEKA放大器,可将Pulse Data通过ABF Utility转换后进行由mini analysis 进行分析
daomei ( 11:12:33)
也不一定要用到哪些东西吧,我现在是用spike2记录数据,分析就是用spike2自身进行一些数据的提取,然后使用excel分析……
xgy412 ( 11:12:57)
Powerlab也可以
大大 ( 11:13:21)
电生理学的实验技术现在较多,不同的电生理信号采集方法,其数据的分析处理方法也各异。传统的脑片细胞内记录(如皖南医学院汪萌芽教授实验室)就可以用Axon公司的clampex及相应的clampfit软件进行采集和分析,后续的实验数据还可以用一些统计软件如SPSS或者直接用Excel上的统计工具,作图工具有CorelDRAW 8等。而目前用于在体清醒动物的神经元多通道记录(如中科院心理所罗非研究员课题组)的数据采集和分析系统都是由Plexon (Dennison , TX) 公司和Bigraphics (Winston-Salem , NC) 公司提供的,采集到的数据可用neuroexplorer软件(简称Nex)进行交互相关分析、主成分分析等等。相见网站。当然也要结合MATLAB之类的编程分析软件使用。除此之外,还要根据实验的具体需要使用一些统计分析软件。电生理学其他的一些技术我没具体用过,不便细说。
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