方法是不是用qrt-pcr

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【原创】qRT-PCR引物
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这个帖子发布于2年零80天前,其中的信息可能已发生改变或有所发展。
primer-balst验证引物特异性时:1. 是不是必须有目的基因出现才行啊? 如果没有,是不是说明primer的特异性不行啊?2. 出现非目的基因,但是大小跟目的基因相差很大,是不是对qRT-PCR没关系啊?
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我一般的做法1. 设计引物的时候去blast比对,基本第一个就是,如果不是,那就是你设计的方法不对。2. 很多情况下,比对结果中,除了目的模板,还有其它模板的非特异性产物结果,一般情况下不影响扩增。当然,理论最好的结果是只有目的模板目的产物。但无论如何,去机器上扩了才知道。
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我一般的做法1. 设计引物的时候去blast比对,基本第一个就是,如果不是,那就是你设计的方法不对。blast时没有出现目的模板,是不是该引物不行啊
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7栋302 primer-balst验证引物特异性时:1. 是不是必须有目的基因出现才行啊? 如果没有,是不是说 ...1. 没有出现目的基因,可能有两个原因,第一,引物有问题,或者是引物上面人为添加了突变,导致和目的基因无法比对。第二,可能是BLAST时数据库选择不对数据库中压根就没有包含目的基因。请核查你的问题是那个原因。2. 因为长度相差较大,在电泳上不会造成区分影响,但会影响扩增效果,毕竟有竞争效应。
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鸡传染性法氏囊病毒实时qRT-PCR检测方法的建立及初步应用什么是realtime PCR,什么是q-pcr,所用反应物质与普通PCR有何不同_百度知道
什么是realtime PCR,什么是q-pcr,所用反应物质与普通PCR有何不同
另外RealTime-q-pcr 是不是就是q-pcr稍微详细点。查查百度百科什么的,我也会,最好附加点做的注意事项
提问者采纳
标曲反应扩增效率,自己查百度百科和文库,不太好解释,如果只有特异的单一融解峰,不然只能用2 delta delta t法了,这样比较准确点,都是一个意思,特别是同一物种不同组织中某基因的表达情况,很难反映原来模板的浓度,原理什么的我就不说了,q-pcr。2 最好有标准曲线,如果有可能可以双内参,它起飞时间的Ct值可以精确反映模板的浓度,别人肯定会argue你的,有些杂志扣的话。定义,一定要别人报道过在你检测的组织中变化不大。1 选好内参基因,而当PCR经过多伦循环到平台期后,我就从实战给你点注意事项吧,q-RT-PCR等等,操作;而实时定量PCR 反映的是PCR的过程,再去分析数据,简称real-time
PCR实时定量PCR (real-time quantitative PCR),如果你只是拿一个别的物种中的同源基因,还可以直接有已知模板来制(可以搜一下网上的标曲制备方法)3 结果先看融解曲线,不然没有意义。普通PCR结果反映的其实是PCR的结果。标曲可以用cDNA来制备
其他类似问题
谓real-time Q-PCR技术。利用荧光信号的变化实时检测PCR扩增反应中每一个循环扩增产物量的变化,是指在PCR反应体系中加入荧光基团,通过Ct值和标准曲线的分析对起始模板进行定量分析,利用荧光信号累积实时监测整个PCR进程,最后通过标准曲线对未知模板进行定量分析的方法
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由于PCR敏感性高,扩增产物总量变异系数大,定量不准确。90年代末期出现了Q-PCR, 利用荧光检测PCR仪绘制DNA扩增过程中的累积速率动态变化图,基本消除在测定终端产物丰度时变异系数较大的问题。混合在PCR反应液中的荧光探针只有与双链DNA结合后,才能够被激发出荧光。随着新合成DNA片段的增加,由于结合到DNA上的荧光探针增加,被激发产生的荧光相应增加。
为确保荧光检测的确实是靶DNA,又设计了仅能与目的DNA特异结合的荧光探针。TaqMan探针是一段与靶DNA序列中间部位结合的单链DNA,长50bp-150bp,该DNA的5’和3’端带有短波长和长波长两个不同荧光基团,由于彼此距离靠近,在荧光共振能量转移(FRET)作用下发生荧光淬灭,因而检测不到荧光。随着PCR反应的进行,TaqMan 探针结合到目的DNA序列上,并且...
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出门在外也不愁QRT-PCR数据的取舍 - PCR实验 - 生物秀
标题: QRT-PCR数据的取舍
摘要: [QRT-PCR数据的取舍] 大家好,我想问一下,CT值相差多少是可信的,如果我扩增了十组样本,每组做两个复孔,9个组的两个CT值相差小于1,有一个组相差很大,超过3 ,我能以相同的条件,再扩增一下这个组么?直至二者CT值接近。此时,我能把这组后来得到的CT值和之前的9组CT值放在一起分析么? 关键词:[]……
大家好,我想问一下,CT值相差多少是可信的,如果我扩增了十组样本,每组做两个复孔,9个组的两个CT值相差小于1,有一个组相差很大,超过3 ,我能以相同的条件,再扩增一下这个组么?直至二者CT值接近。此时,我能把这组后来得到的CT值和之前的9组CT值放在一起分析么?
回复Ct值小于1才算是平行性较好,相差大的组的Ct值是不是比较大,超过30个循环啊,如果CT值大的话平行性不好正常的。回复Ct值小于1才算是平行性较好,相差大的组的Ct值是不是比较大,超过30个循环啊,如果CT值大的话平行性不好正常的。嗯,我是扩40个循环,有的组CT值相差3-4,我想再单独把这些组做一下,然后和之前的结果一起分析?请问您遇到过这种问题么?回复我是CT值超过35个循环才会出现这种情况的。回复这样没有可比性呀 条件不一致 最好是在同一次试验统计数据回复这样没有可比性呀 条件不一致 最好是在同一次试验统计数据加大样都是一样的,循环次数也是一样的。如果不能比的话,我做了一板,因为一两组数据平行性不好,所有的数据都应该重新做么?回复在不同一板上机时 有不一样的因素:相同试剂、扩增的条件等都一样时,也有人为操作与问题导致结果不一致,要是你的试验要求不是那么严格话 也可以这么统计数的回复加大样都是一样的,循环次数也是一样的。如果不能比的话,我做了一板,因为一两组数据平行性不好,所有的数据都应该重新做么? 如果是操作者,,体系,条件都相同的话,可以将不好的重新做,而不用做其它好的了。回复 如果是操作者,,体系,条件都相同的话,可以将不好的重新做,而不用做其它好的了。哦,请问这样的结果能发文章么?还想问一下,文章中都说来自三个独立的结果,是不是说我每相同处理需要提三次RNA,然后分别反转,再每一组做三个复孔,取平均值进行统计么?这样算来一中处理就是9个孔,是不是太多了?回复哦,请问这样的结果能发文章么?还想问一下,文章中都说来自三个独立的结果,是不是说我每相同处理需要提三次RNA,然后分别反转,再每一组做三个复孔,取平均值进行统计么?这样算来一中处理就是9个孔,是不是太多了?这就要看你的实验设计了,原则上最好是这么做的,不过这么做很难做到平行,但是应该能保证趋势是一样的。回复这就要看你的实验设计了,原则上最好是这么做的,不过这么做很难做到平行,但是应该能保证趋势是一样的。我现在就是趋势都不一样,不知道哪边出问题了?回复我现在就是趋势都不一样,不知道哪边出问题了?你说趋势不一样是什么意思呢?我也在做荧光,我现在最大的问题就是样本间内参Cp值相差比较大,但是要将样本间内参调齐是件非常难的事情。所以我不知道你说趋势不一样是指什么呢?回复你说趋势不一样是什么意思呢?我也在做荧光,我现在最大的问题就是样本间内参Cp值相差比较大,但是要将样本间内参调齐是件非常难的事情。所以我不知道你说趋势不一样是指什么呢?就是第一次和第二次做结果不同,重复性不好,有时两个复孔的CT值也相差很大。我做的是细胞,种板时相同浓度种的,一样的提法,所以内参一批的话,差的不太多。但是我的内参一直污染,合成好,刚溶解,再做,就是污染,我在检验科做,不知和我们科里天天处理很多的血样,形成气溶胶有没有关系。回复哦,原来是这样。不过我的实验重复性也不好,而且荧光PCR这个东西非常耗钱,每天实验也都是担心吊胆的。回复就是第一次和第二次做结果不同,重复性不好,有时两个复孔的CT值也相差很大。我做的是细胞,种板时相同浓度种的,一样的提法,所以内参一批的话,差的不太多。但是我的内参一直污染,合成好,刚溶解,再做,就是污染,我在检验科做,不知和我们科里天天处理很多的血样,形成气溶胶有没有关系。肯定是有些关系的,将配制混合液和加模板的区域分开吧。回复肯定是有些关系的,将配制混合液和加模板的区域分开吧。只有一个屋子,呵呵,资源紧张,只好将就了回复只有一个屋子,呵呵,资源紧张,只好将就了屋子不用分开,就是实验台和枪分开。回复屋子不用分开,就是实验台和枪分开。您好,请问real-time PCR做相对定量时,拿control组作为对照,用2-ΔΔCT法计算后得到的contro组数据应该都为1,标准差应为0,那文献中的标准差(error bar)是用什么方法计算得到的呢?是拿control的三个值除还是减均值啊?
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