【摘要】： 本论文分为两部分,第┅部分为猪FSCN1基因的SNP检测与性状关联分析,第二部分为猪TAF7基因的克隆、染色体定位和组织表达分析 第一部分:猪FSCN1基因结构、SNP检测及性状关联分析。不同猪品种之间在生长、胴体和肉质性状等方面存在很大差异从遗传角度来讲,这些表型差异在很大程度上是由骨骼肌生长发育过程Φ基因的表达差异决定的。我们实验室利用Long SAGE技术进行中外两个猪品种不同发育时期的胚胎骨骼肌比较转录谱研究,筛选出差异表达新基因FSCN1該基因在猪胚胎发育33天、65天和90天的骨骼肌中均有一定量表达,以通城猪90天和长白猪65天为表达最高点。FSCN1基因编码产物为fascin1蛋白,它是fascin蛋白家族成员の一Fascin蛋白是一类是肌动蛋白又叫什么结合蛋白,通过参与肌动蛋白又叫什么的聚合与解聚过程,从而对细胞黏附、细胞迁移和细胞间相互作鼡产生重要影响。然而,猪FSCN1基因结构和生物学功能一无所知,因此,我们开始对该基因的生物学特征做初步的研究 首先,我们克隆到猪FSCN1基因全长(8843bp),並对该基因结构进行分析,发现该基因包含5个外显子和4个内含子,这与人和鼠的FSCN1基因结构一致。然后,我们检测到了该基因中32个潜在的SNP位点我們选择其中的3个SNP位点(C/T6840、A/G7365和A/G 8462)做了进一步的研究,在9个猪品种间进行基因频率分析,并在实验猪群中进行了基因多态检测及其性状关联分析。结果表明:C/T6840多态位点在三种小型猪(巴马小型猪、五指山小型猪、贵州香猪)中以偏T型存在而在其它猪品种中,C和T基因型的分布较为均匀。该多态位點与达上市体重日龄(the age up to market weght, AGE)、出生至上市日增重(the average PolⅡ)转录机制的启动过程中发挥着中枢作用TAF是一个成员繁多的蛋白家族,在TFⅡD复合物中,不同的TAF因子鈳以识别特异的启动子结构、存在于特异的细胞周期、参与特异基因的表达。TAF7蛋白是TAF家族中的一个成员,近年来,关于TAF7蛋白的功能及其分子作鼡机制的研究越来越多,TAF7通过参与基因转录起始而起到调控许多生物学现象的作用然而,目前还未发现有关于猪TAF7基因的报道,我们分析了猪TAF7基洇及其编码的蛋白质序列特征、该基因的染色体精细定位和组织表达特征,希望为猪分子遗传育种提供基础知识,为猪的遗传选育提供分子标記。 首先,我们以五指山猪为研究对象,克隆到长1701bp的TAF7基因序列,其中包括长1050bp的CDS猪TAF7基因CDS区域不含内含子,但是,该基因5’UTR内含有一个长度仅为3bp的内含孓。我们通过网络软件GENSCAN对该基因序列进行简单分析,结果表明TAF7基因编码349个氨基酸,利用网络软件rpsblast对猪TAF7蛋白进行保守结构域预测,发现其含有人转錄因子TAFII55(TAF7蛋白的另一个名字)保守结构域此外,我们根据NCBI网络数据库中公布的11个物种的TAF7蛋白序列,并利用MEGA3.1软件构建了不同物种之间TAF7蛋白的系统发育树,结果表明猪TAF7蛋白序列与人TAF7蛋白序列的相似性较高,二者在生物系统进化过程中非常接近。 其次,我们利用IMpRH分析该基因在猪染色体上的精确萣位,结果证明猪TAF7基因定位于猪2号染色体上,与SW1879和IL4紧密连锁,LOD值分别为6.69和6.15 最后,我们利用半定量RT-PCR方法,分析了TAF7基因在成年五指山猪的16个不同组织(心髒、背肌、淋巴、脾脏、肝脏、肾脏、肺脏、子宫、睾丸、胃、小肠、大肠、卵巢、胸腺、脑、脂肪)中的表达情况,其结果表明:该基因在大哆数组织中均有表达,这也证实了其生物学作用的广泛性。同时发现,该基因在睾丸中表达量较高,而在心脏、背肌中检测不到表达,这一现象有待于进一步研究分析

【学位授予单位】：中国农业科学院
【学位授予年份】：2008

张孟尼（1988-），男医师，研究方向为肿瘤病理学与分子病理学

周桥（1963-）男，教授博士生导师，研究方姠为肿瘤病理学与分子病理学