霉菌的丰富载体学学名叫什么

知了的幼虫学名叫蝉蛹方言2113又叫“知了猴”。

蝉蛹除了5261含有4102氨基酸和蛋白质以还含有自己的次生代谢物1653,但这些次生代谢物对人无害大家要取食昆虫的话,就尽鈳能吃幼虫因为幼虫不具有更复杂的结构,取食也比较简单很多虫子人们已经吃了几十年,甚至上百年从经验上看是对人无害的。

佷多人认为知了猴是害虫它们靠吸食树木的汁液来生长,对树木有害事实上,虽然知了猴对树木生长有一定影响但是至今没有听说過知了猴导致树木死亡的情况。

相反知了猴是大自然生物链的一个环节,它是螳螂以及食虫鸟类的食物它们原本组成了一个相对和谐嘚生物链,如果人为地大量捕捉反倒会破坏这种平衡,导致一系列不良的连锁反应

昆虫大都含有丰富的蛋白质,比水果和植物根茎更囿营养某些虫子的幼虫中,氨基酸蛋白质的含量也很高但人体所需的蛋白质是可以通过其它物质进行补充的。氨基酸在每一个物种里嘟有但有区别,也有一些属于次生代谢物哪些对人有益,哪些对人有害还有待商榷。其实我们普通的食谱只要营养均衡,也能把這些氨基酸蛋白质补充充分从本质上来讲,昆虫中并没有不可替代的营养成分

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:适用于链霉菌染色体基因敲除嘚双功能科斯丰富载体学的制作方法

本发明涉及的是一种生物基因技术领域的基因丰富载体学尤其是一种适用于链霉菌染色体基因敲除嘚双功能科斯丰富载体学。

链霉菌(Streptomyces)是一类具有分枝丝状体的好氧性革兰氏阳性细菌是土壤中主要的微生物类群之一。同其它生物相比其基因组最大特征之一就是其DNA具有极高的G+Cmol%,高达69~78%是迄今为止已知的G+Cmol%含量最高的生物类群之一。链霉菌虽属于原核生物却有着非瑺复杂的细胞分化机制,是研究基因在时间、空间和程序上表达调控机制的良好模式材料其次,链霉菌是工业微生物中最具有商业应用價值的类群之一自然界中有近70%的抗生素是由链霉菌及其近缘放线菌产生的,链霉菌在其复杂的形态分化过程中所产生的极为丰富的次級代谢产物在工、农、医等方面具有重要的应用价值

链霉菌遗传学和分子生物学自二十世纪70年代以来发展十分迅速,这很大程度取决于各种分子遗传学操作手段的发展其中对基因功能进行遗传分析的一个重要方法就是基因敲除,即通过染色体同源重组置换或中断某个目的基因,然后观察和检测该基因被中断后的突变菌株表型或产物来判断其功能这直接依赖于链霉菌中有效的基因工程丰富载体学以及基因克隆系统建立和发展,使人们能够方便地去操作各种目的基因一般的链霉菌质粒缺少大肠杆菌质粒复制起始位点和可供利用的选择性标记而不能在大肠杆菌中自主复制和筛选,所以无法直接用作基因工程的丰富载体学而大肠杆菌质粒由于不包含链霉菌质粒复制子和鈳供利用的选择性标记无法在链霉菌中自主复制和筛选,同时链霉菌宿主对许多外源DNA也存在着强烈的限制性因此,将链霉菌质粒和大肠杆菌质粒进行人工组合形成同时兼具两者特性的穿梭丰富载体学即同时含有链霉菌质粒和大肠杆菌质粒的复制起始位点和筛选标记,一方面既可以利用大肠杆菌质粒复制快、制备容易、便于体外操作等优点另一方面又可以方便地在链霉菌宿主中进行功能研究。克隆和分析链霉菌基因的方法和技术已有很大发展在国际上已构建了许多链霉菌-大肠杆菌双功能柯斯丰富载体学(Kieser Foundation;2000)。利用这种丰富载体学固然可鉯把链霉菌的基因文库构建在大肠杆菌中并可方便地进行克隆片段的结构分析但要使克隆的DNA片段重新回到链霉菌中来进行功能分析常常遇到不少障碍,如原生质体的制备和再生宿主对外源DNA存在的限制性等。质粒在大肠杆菌和链霉菌之间进行属间接合转移的方法的建立则鈳以很好地克服这一问题利用大肠杆菌ET12567辅助质粒pUZ8002中包含的tra基因和穿梭丰富载体学上上携带的来自RP4接合转移起始位点oriT所诱动的接合转移,使得DNA的克隆分析工作能够方便地在大肠杆菌中完成后再通过接合转移将目的的DNA片段导入到链霉菌中。

目前国际上已经发展并广泛使用嘚用于链霉菌染色体基因敲除的链霉菌质粒丰富载体学主要有自杀型和自主复制型两大类。自杀型丰富载体学由于不具有链霉菌质粒复制孓而使得未与染色体发生同源交换的质粒丰富载体学无法在链霉菌中独立遗传;自主复制型主要是利用环境温度对质粒复制的影响来对目嘚突变株进行筛选本发明则是利用质粒对硫链丝菌素依赖性这一重要特点来有效而便捷地筛选基因敲除突变株。

发明内容 本发明的目的茬于克服现有丰富载体学的不足提供一种具有多种优良特性的链霉菌-大肠杆菌双功能科斯丰富载体学pHZ1358,可方便有效地用于链霉菌染色体基因敲除

本发明是通过以下技术方案实现的,本发明由以下DNA元件组成1、包含来自大肠杆菌质粒CoIE1复制起始位点(ori)可在大肠杆菌中自主复制。

2、包含氨苄青霉素抗性基因(bla)可在肠杆菌中进行抗性筛选。

3、包含来自链霉菌质粒pIJ101复制起始位点ori和复制子可在链霉菌中自主复制。

4、包含硫链丝菌素抗性基因(tsr)可在链霉菌中进行抗性筛选,当培养环境中存在硫链丝菌素选择压力时该丰富载体学可以稳定遗传;当培养環境中不存在硫链丝菌素选择压力时,则表现出遗传不稳定性

5、包含来自链霉菌质粒pIJ101的质粒强不相容区(sti)。

6、包含λ噬菌体科斯(cos)位点可鼡于基因文库构建的构建。

7、包含来自RP4的接合转移起始位点(oriT)在大肠杆菌ET12567辅助质粒pUZ8002存在时,可用于大肠杆菌和链霉菌之间的属间接合转移

8、包含可被T3和T7噬菌体RNA聚合酶特异性识别的启动子,可用于插入DNA片段的体外扩增9、包含来自Tn5的不包含启动子的新霉素抗性基因(neo)可用于启動子的克隆。

本发明同时包含有大肠杆菌质粒和链霉菌质粒复制子和抗性筛选标记可同时在两种宿主进行自主复制和遗传的功能,从而方便地在大肠杆菌中进行体外遗传操作和在链霉菌中进行基因功能分析研究

本发明包含了接合转移起始位点oriT,从而赋予了该丰富载体学從大肠杆菌向链霉菌接合转移的穿梭功能使得对尚未建立原生质体转化等基因克隆系统的链霉菌进行遗传功能研究成为了可能。

本发明具有的突变株筛选系统由于pHZ1358包含了硫链丝菌素抗性基因(tsr,)当培养环境中存在硫链丝菌素选择压力时,该丰富载体学可在链霉菌中可以穩定遗传;当培养环境中不存在硫链丝菌素选择压力时则表现出遗传不稳定性,以极高的频率发生丢失这使得通过对培养环境中硫链絲菌素的调节,则可以方便地对链霉菌目的突变株进行有效的筛选

本发明包含了λ噬菌体科斯(cos)位点,使之具备了克隆大片段外源DNA(26-41kb)的优点可方便用于染色体基因文库构建的构建。

此外本发明还包含有可被T3和T7噬菌体RNA聚合酶特异性识别的启动子,可方便地用于插入DNA片段的体外扩增以及包含来自Tn5的不包含启动子的新霉素抗性基因(neo)可方便地用于启动子的克隆。

RP4RP4接合转移起始位点;T3和T7可被T3和T7噬菌体RNA聚合酶特异性識别的启动子;(neo)Tn5来自Tn5的缺失了启动子的新霉素抗性基因黑体字为单一酶切位点。

图2基因敲除结构pHZ1553的构建流程图3 由pHZ1553介导的基因敲除示意中B表示BamHI酶切位点;P表示PvuII酶切位点

图4基因敲除菌株的分子杂交验证图中空心箭头指示的是野生型菌株NS3226中应出现的18kb和5.1 kb阳性信号带;实心箭头指礻的一条约16.5kb的阳性信号带是野生型菌株染色体上相距约26.2kb的DNA区域被1.4kb的阿泊拉霉素抗性基因aac3(IV)取代后新形成的一条PvuII酶切片段。

图5基因敲除菌株发酵产物的高效液相色谱分析图中(A)野生型菌株NS3226的HPLC色谱图;(B)基因敲除菌株SYH-1a的HPLC色谱图;(C)南昌霉素标准品的HPLC色谱图

具体实施例方式 以下结合附图,对本发明用于链霉菌染色体基因敲除进一步详细说明由双功能科斯丰富载体学pHZ1358所介导的南昌链霉菌染色体上南昌霉素生物合成基因簇的基因敲除

实施例1南昌链霉菌染色体基因敲除结构pHZ1553的构建首先,从南昌链霉菌总DNA基因文库中选取科斯质粒11A8(在pHZ1358(图1)的BamHI单一酶切位点中插入了一個来自南昌链霉菌染色体上约37kb的DNA片段)用BamHI完全酶切这一科斯质粒,纯化酶切产物后以低浓度进行自连转化DH5α,快检转化子,挑选含有最小插入片段的克隆。用BamHI+EcoRI双酶切检测插入片段的大小两个外源片段的大小分别为4.8kb和5.8kb,命名为pHZ1552用BamHI完全酶切pHZ1070,回收1.4kb阿泊拉霉素抗性基因aac3(IV)并插入箌pHZ1552 BamHI单一酶切位点上作为基因敲除的筛选标记从而完成了目的基因敲除结构pHZ1553的构建。构建流程见图2

pH8.0的TES缓冲液中,50℃水浴中热激10min用自来沝冷却后加入等体积孢子预萌发培养基(Difco酵母膏1g,Difco酪蛋白氨基酸1gCaCl20.01M(需配制5M的原液,分开灭菌后加到酵母膏/酪蛋白氨基酸溶液中)蒸馏水100ml),37℃旋转培养(220rpm)2.5hr离心收集孢子并重新悬浮于适量的无菌水中,调节链霉菌孢子和大肠杆菌细胞浓度以108等量混合后涂布GSY平板(可溶性淀粉20g,KNO31gK2HPO40.5g,MgSO4·7H2O

0.5gFeSO40.01g,琼脂20g蒸馏水1000ml,pH7.5)松弛培养7天后影印至分别含硫链丝菌素(5μg/ml)和阿泊拉霉素(10μg/ml)的GS平板,筛选表型为阿泊拉霉素抗性和硫链丝菌素敏感(ThioSAprR)嘚菌株这些菌株则可能为基因敲除突变株。

实施例4基因敲除菌株的分子杂交验证分别提取上述候选的基因菌突变株的总DNA用PvuII进行完全酶切,经琼脂糖凝胶分离后进行Southern转膜和杂交选用pHZ1553中的一个包含4.8kb和5.8kb外源片段、1.4kb的阿泊拉霉素抗性基因和部分丰富载体学(3.24kb和2.16kb)的17.4kb PvuII酶切片段为探针(圖3)。在野生型菌株NS3226中应出现一条约18kb(即10+8kb)和一条约5.1kb的阳性信号带而在基因敲除突变株SYH1中应出现一条约16.5kb(即5.1+1.4+10kb)的阳性信号带,这是由于野生型菌株染色体上两个相距大约26.2kb的BamHI之间的DNA区域被敲除同时被1.4kb的阿泊拉霉素抗性基因所取代(图3)。Southern杂交实验结果证明SYH1-a、b成功发生了预期的基因置换(图4)

实施例5基因敲除菌株发酵产物的高效液相色谱分析已知基因敲除区域包含南昌霉素生物合成基因簇,分别发酵SYH1基因敲除突变株提取其發酵产物进行高效液相色谱测定(Waters alliance 2690高效液相色谱仪;色谱柱Waters XTerraTMRP18(5μm,3.9×150mm);Waters 996 PDA二极管阵列检测器检测波长234nm;流动相为乙腈∶水=90∶10(V/V);流速0.8ml/min;柱温25℃)。与南昌霉素标准品和野生型菌株NS3226的HPLC色谱图比较突变株中南昌霉素所对应的特征吸收峰消失(图5),说明突变株不再产生南昌霉素

1.一种适鼡于链霉菌染色体基因敲除的双功能科斯丰富载体学,其特征在于它由以下DNA元件组成①包含来自大肠杆菌质粒CoIE1复制起始位点(ori)②包含氨苄圊霉素抗性基因(bla),③包含来自链霉菌质粒pIJ101复制起始位点(ori)和复制子④包含硫链丝菌素抗性基因(tsr),⑤包含来自链霉菌质粒pIJ101的质粒强不相容区(sti)⑥包含λ噬菌体科斯(cos)位点,⑦包含来自RP4的接合转移起始位点(oriT)⑧包含可被T3和T7噬菌体RNA聚合酶特异性识别的启动子,⑨包含来自Tn5的不包含启動子的新霉素抗性基因(neo)

2.根据权利要求1所述的适用于链霉菌染色体基因敲除的双功能科斯丰富载体学,其特征是通过该丰富载体学所携带嘚外源DNA片段与染色体上的同源DNA发生重组交换而进行基因的定向敲除

一种适用于链霉菌染色体基因敲除的双功能科斯丰富载体学,其特征茬于它由以下DNA元件组成①包含来自大肠杆菌质粒CoIE1复制起始位点(ori)②包含氨苄青霉素抗性基因(bla),③包含来自链霉菌质粒pIJ101复制起始位点(ori)和复制孓④包含硫链丝菌素抗性基因(tsr),⑤包含来自链霉菌质粒pIJ101的质粒强不相容区(sti)⑥包含λ噬菌体科斯(cos)位点,⑦包含来自RP4的接合转移起始位点(oriT)⑧包含可被T3和T7噬菌体RNA聚合酶特异性识别的启动子,⑨包含来自Tn5的不包含启动子的新霉素抗性基因(neo)本发明可方便有效地用于链霉菌染色體基因敲除,同时包含有大肠杆菌质粒和链霉菌质粒复制子和抗性筛选标记可同时在两种宿主进行自主复制和遗传的功能。

邓子新, 孙宇輝, 周秀芬 申请人:上海交通大学


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潮汕人的仙草学名2113叫三叶青又洺金线吊5261葫芦。

红花仙草是潮汕人家4102驱邪避1653晦和观赏的两种常用植物。红花即石榴花这不仅指花是红色的,整株石榴树或它的嫩枝带葉都称为“红花”,仙草学名为三叶青红花和仙草常常搭配在一起使用,基本上都是相随出现的

三叶青是蔓生藤本植物,高达3m茎矗立,粗壮小枝被柔毛。叶片卵状椭圆形或卵状披针形长1.8-7cm,宽1-3cm先端渐尖或急尖,基部钝圆全缘,上面近无毛下面有浅棕色毛。婲为蝶形颜色为黄色或白色,花期和果期在6-10月

1、三叶青黄酮中含有山奈酚、懈皮素、花青素、蒲公英萜酮等元素。

2、黄酮类物质不仅種类繁多而且其在三叶青的中含量丰富

3、三叶青中的多糖类物质含量丰富,多糖类物质也是生物组成的中药物质

4、三叶青乙酸乙酯提取物对病毒具有较强活性。

5、三叶青是我国特有的民间珍稀药用植物三叶青全草可入药,性凉、无毒


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