血的基因检测抽哪里的血。外显组15有合适的。把想要吗

这个问题听起来有点傻吧,照照镜子谁都能认得这张再熟悉不过的脸,但更深层次呢你认识自己吗?

当然我们不是一个都市鸡汤号,我们暂不讨论心灵的健康与洎我价值的实现……今天我们要探索的自我,不是一个65kg的自我或一个165cm、178cm的自我,而是一个枯燥但神秘、容量3个G的“自我”

前些年,囿一家叫做23 and me的公司在国外特别火只要将你的一口唾沫和99美元寄给这家公司,你就能知道自己祖先的起源:纯正的汉族五代以上有蒙古先人?奇妙的0.1%欧洲血统……

不过,这种检测更多是为了有趣真正“有关23”的检测可比这要复杂得多得多得多,接下来就让我们一起來烧烧脑,了解一下基因检测抽哪里的血的进阶版:

全外显子组测序是什么?

我们知道正常人有23对(46条)染色体,一半来自父亲一半来自母亲。而基因就是这些染色体上的一段序列科学家发现,全部人类基因组约有39000多个基因大小约为3个G。

基因由外显子和内含子组荿外显子和内含子是由A、T、C、G4种碱基组成的DNA序列。外显子部分的序列主要参与蛋白质的编码而蛋白质是执行生理功能的重要分子。因此外显子序列的突变参与疾病的可能性更大,也具有重要意义

全外显子组测序就是选择性地捕获并检测了外显子部分的序列。测序获嘚的原始碱基序列并不能直接与疾病挂钩这些枯燥繁复的ATCG需要通过后期一系列的生物信息学分析、比对、注释,才能成为一份“全外”報告整个过程需要耗费很长的时间。

在浙二神经内科为了进一步明确诊断,不少患者会被医生建议进行基因检测抽哪里的血当拿到檢测结果的时候,大家常常会困惑报告看不懂不知从何下手。那么我们就从一份真实报告着手,好好看看这份“揭露真我”的报告究竟讲了什么?

这部分比较简单主要记录了检测对象的基本信息。并告诉我们检测的项目和方法(全外显子组测序)患者收到报告后鈳以核对信息是否正确。

敲黑板这部分很重要!全外显子组共检测人类的25000多个基因。在和标准基因组序列比对后我们会发现每个人都攜带了成千上万的变异。

但并不是只要有变异就是有害的也不是所有的变异都和疾病有关。这里的检测结果是遗传分析人员经过大量筛選分析后挑选出来和患者的临床表现较为相关的几个基因。还需要强调的是判定一个变异的致病性需要临床医生结合患者的表现具体汾析,列在这里的基因并不一定就是致病基因采集家属的血样进行检测,作为分析的对照也很重要

基因:即基因的名字,如“SCN1A”

转录夲:在这个报告里是“NM_”。转录本是比较专业的名词通俗地说,DNA产生mRNA(信使RNA)然后在合成蛋白质时,mRNA就是合成的模板通过它来翻譯出蛋白质。转录本就是一个mRNA的“身份证”根据这个编号,专业人员就能知道对应的是哪个mRNA

基因的转录与翻译,感兴趣的可以看看哦

“基因亚区”和“突变信息”

主要为了说明突变的具体位置。具体的就交给专业人员看吧

“突变类型”和“遗传方式”

隐性遗传?显性遗传杂合突变?……

这些名词是不是“好像有听过但并不记得是什么意思?"那接下来就是高中生物的补习时间:

常染色体隐性遗傳(AR):致病基因位于常染色体上,基因性状为隐性需要两条染色体均发生突变才会致病。

常染色体显性遗传(AD):致病基因在常染色體上基因性状为显性,只需要1条染色体上携带突变就会致病

致病性分类是根据美国医学遗传学和基因组组学学院制定的指南来分级的。共有5个等级:

临床意义未明确的(VUS)

对变异进行致病等级的划分可以帮助医生和患者了解这个变异与疾病是否相关

在报告中,前三类較为常见如果看到致病的,或者可能致病的那很有可能是找到了致病基因,但仍需有经验的临床医生进一步评估这个等级的划分是軟件根据指南自动打分给出的结果,是可以变化的如果后续增加新的证据,如通过家属血液样本检测给出的证据突变的致病等级就需偠临床医生根据指南再评估。

即对应的基因会导致的疾病名称该疾病具体的临床表现在“结果说明”栏目可以看到。

RS号:这是科学家给巳发现的单核苷酸变异(SNP)的一个身份标识遗传分析人员可以通过RS号在数据库里查询关于该变异的更多信息。

文献:可以提示是否已有楿关的文献报道该突变位点

这一部分是对“主要检测结果”的进一步说明,如突变位点的人群频率信息

1000Genoms数据库、ExAC数据库、gnomAD数据库都是瑺用的人群数据库,如果突变位点在人群中的频率高于5%则可作为良性变异的独立证据。反之在人群中突变频率越低则有害的可能性越夶。

SIFT软件、Polyphen-2软件、MutationTaster软件等错义突变软件可根据错义突变影响蛋白的结构、保守性等预测突变位点对蛋白功能的破坏作用。软件的预测可鉯作为分析突变致病性的支持证据Damaging意为有害的。对于基因所对应的疾病这部分也有较为详细的描述。

这里密密麻麻的列的是本次全外检测的基因。

这部分用以说明本次测序的质量目标区域覆盖度能达到99%以上是测序质量合格的一个指标。

全外显子组测序是二代测序測序准确性较高,假阳性率大约为0.01%为了保证结果的可靠性,我们会对怀疑的突变进行sanger测序以验证突变的真实性。

全外显子组测序的局限性

任何检测方法都有自身的优势和局限性全外显子测序也不例外。

常常有患者问:做了全外显子检测是不是把和遗传相关的病因都查叻

全外显子组测序确实相对全面,囊括了非常多的基因主要筛查的是基因的点突变和小的插入缺失突变。但由于遗传突变的复杂性吔难免有漏网之鱼,如大片段的缺失重复动态突变等等。这些需要临床医生结合患者的病情在有需要的情况下,运用其他的检测手段來发现

这部分给出了获得原始测序数据以后,数据分析的流程内容比较专业,感兴趣的朋友可以自己了解

如果发现的突变已有相关攵献报道,则会在下面列出相关文献但文献更新较快,可能存在已有文献报道但尚未写入报告的情况

怎么样,看到这里你对基因报告是不是有更多了解了?读读浙二公众号是不是又找回了当年学习的感觉?每天看一篇学霸小明星就是你哦!

《医生教你读报告》系列

第一期:医生,这报告单上的一串英文啥意思是说我得癌了吗?!

看完这个系列,没准你也能当个“家庭医生”了呢!

浙大二院副院长神经病学研究中心主任,神经内科主任医师、博士生导师国家杰出青年基金获得者,新世纪百千万人才工程国家级人选国务院政府特殊津贴专家。长期从事神经内科的临床、教学和科研工作擅长神经遗传病和运动障碍病等罕见病的诊治,并采用遗传和分子技术尋找疾病的致病基因研究其发病机制并优化治疗方案。

门诊时间:周二上午(国际医学中心)周五上午(解放路院区名医馆)

(原标題《你多大呢?2835?还是47今天我们要讨论的你,却永远是3个G那么大……》编辑王蓉蓉)

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基因检测抽哪里的血可以用来做什么要弄明白这个问题,首先要知道什么是基因基因是我们的遗传物质,又称DNA位于染色体上。通常每个体细胞内都有两个拷贝一份来自父亲,一份来自母亲人与人之间99.9%的基因序列都是一样的,正是那不同的0.1%造就了这个物种如此丰富的多态性长相性格体质喜好千差万别。而基因检测抽哪里的血可以告诉我们自己的基因长什么样、和其他人有哪些不同以及这些不同会不会有什么不得了的后果。操莋过程也很简单只需要采集少量血液,或者刮取一点儿口腔上皮细胞剩下的工作交给实验室和测序仪就好。

知道自己的基因序列又有什么卵用呢做亲子鉴定吗?当然可以不过未免也太大材小用。基因和疾病息息相关基因检测抽哪里的血在医疗健康领域也应用颇广,从备孕、产检到疾病的风险预测、诊断和治疗,简直贯穿了我们整段人生——

想要优生优育基因检测抽哪里的血不可或缺——每个镓庭都想要个健康的宝宝,然而有些人会携带一些遗传病的隐性致病基因例如囊性纤维化、血友病、地中海贫血等。这些人自身不会发疒却有可能把不正常的基因传给下一代,如果恰好伴侣也携带同样的致病基因孩子患病风险就比较高了。此时基因检测抽哪里的血可幫助他们了解风险作出更好的决定。过了备孕一关可胚胎发育并不总是十全十美,偶尔也会出个差错本来是23对染色体,可有一对非偠再整出第三条这就是大家常听说的21-三体综合征(又名唐氏综合征)了。传统检测方法是羊膜穿刺费力受罪还有流产风险,而现在只鼡抽取孕妇血液里面有微量的胎儿基因,通过基因检测抽哪里的血可以非常方便地判断是否有染色体异常

在疾病治疗时,基因检测抽哪里的血也用处颇多任何疾病都讲究对症用药,例如癌症癌细胞里的基因突变不一样,适合的抗癌药也不一样例如,化疗药爱必妥(cetuximab)鼡于结肠癌的治疗不过如果肿瘤里有KRAS基因突变,药物就无济于事了通过基因检测抽哪里的血,可以甄选出合适的病人对症给药,避免走冤枉路耽误病情。除了癌症其他时候临床用药基因检测抽哪里的血也能帮大忙,我们常说离开剂量谈毒性就是耍流氓,离开剂量谈治疗也是如此如何确定用药剂量呢?有时候这不仅仅是疗效问题还可能生死攸关——例如抗凝药华法林,如果病人携带一种CYP2C9基因變异代谢该药速度很慢,如果仍是给予常规剂量药物会在身体里累积,本来是防止血栓形成的救命药会变成导致出血甚至死亡的索命藥基因检测抽哪里的血可以帮助判断病人的代谢类型,精确给药

话说治已病不如治未病,多数人最关心的问题可能是:我将来会不会患上什么病我有癌症家族史,我将来也会患癌症吗基因检测抽哪里的血也能派上用场。人们已经发现基因组上许多位点的突变会影响疾病风险例如安吉丽娜·朱莉的携带的BRCA1基因的致病突变使得她患乳腺癌的风险增加到87%。基因检测抽哪里的血可以看看你是否携带有高风險的基因突变知晓自己的患病风险后,便可未雨绸缪尽量预防和早期发现疾病,防患于未然

一言以蔽之,基因检测抽哪里的血已经開始渗透入我们生活的方方面面未来的医疗逐步个体化精准化,基因检测抽哪里的血是不可或缺的一环

如果你是安吉丽娜?朱莉……

咹吉丽娜·朱莉为预防癌症而切除乳腺和卵巢的惊世之举,将基因检测抽哪里的血和疾病风险预测带入了大家的视野。基因和癌症有什么关系

癌症成因复杂,环境和个人生活习惯影响颇大基因也常常来插一脚。如果不幸携带有一些基因突变患癌风险会增加,这些基因就昰所谓的“癌症易感基因”目前人们已经发现一百多个,包括著名的乳腺癌易感基因BRCA1BRCA2它们的致病突变会大大增加女性患乳腺癌和卵巢癌的风险。对于朱莉这样有癌症家族史并且携带BRCA基因致病突变的女性,乳腺切除术或者输卵管卵巢切除术可显著降低癌症风险和死亡率

如果你渴望知道自己的患病风险,特别像朱莉这样有疾病家族史的情况下没准基因检测抽哪里的血可以帮你忙,至少对乳腺癌来说昰如此研究较多,风险预测比较成熟那么接下来问题来了:知道了自己的患病风险,又有什么卵用呢并不是所有人都能嫁给布拉德·皮特,都有勇气做激进的预防性切除手术。不过,其实还是有不少温和的干预措施:我们改变不了自己的基因,但可以改变自己的生活习惯;我们控制不了疾病的发生,但可以勤做体检,早期发现疾病;我们控制不了患病风险却可以将风险分散,例如买份保险

说起保险,不少人就犯嘀咕了:如果我做了基因检测抽哪里的血结果是患病风险高,保险公司提高我的保费怎么办事实上一直以来,基因检测抽哪里的血和保险行业的合作就颇具争议保险行业的传统做法是对客户进行细分,对高风险人群提高服务价格甚至拒保如果在基因检測抽哪里的血领域也照搬这一模式,无疑是基因歧视大家肯定接受不了。美国很有先见之明地早在2008年就通过了“反基因歧视法案”( Genetic Information Act)规萣保险公司在提供医疗保险时不得利用遗传信息和预测的疾病风险对客户区别对待。现在美国的基因检测抽哪里的血和保险行业是如何运莋的呢以BRCA基因检测抽哪里的血为例,奥巴马医疗法案已经将之纳入预防性检查的范畴由保险公司负担费用。通常一份保单包括的预防性基因检测抽哪里的血越多这份保单也越昂贵,因为一旦结果是高风险保险公司得负担后续的高额检查费用和可能的治疗费,因此能被保险覆盖的基因检测抽哪里的血并不多

中国的情况如何呢?目前基因检测抽哪里的血并未纳入基本医疗保险里如果我们想做基因检測抽哪里的血,可以找测序公司或体检机构不过这一市场鱼龙混杂,去年国家叫停了基因测序临床应用意在规范市场。今年又再度放開通过了第一批基因测序临床应用试点单位,其中包括测序行业的龙头老大华大基因

在这样的背景下,基因检测抽哪里的血和保险机構的合作也方兴未艾正在探索可能的运作模式,例如购买一份保险附带提供基因检测抽哪里的血服务,如果预测患病风险较高在基夲的保险责任之外,还提供附加的体检服务以便早期发现疾病这种模式下患病风险并没有作为保费定价依据,而只是用来给指导干预手段例如体检的频率。这种融合基因检测抽哪里的血、体检服务和保险保障的新兴保险模式不失为一次新颖有趣的尝试。购买一份保险產品没有基因歧视的困扰,既能了解患病风险又能体验量身定做的体检服务,万一真的生病还有保险保障——可谓一举三得

总之,基因检测抽哪里的血的发展正在催生一批新的产业,建立起新的健康管理模式当然,完善相关的法律法规也是当务之急

检测有局限,解读需谨慎

虽然基因检测抽哪里的血发展得如火如荼但也不要对之过分客观,目前能进行成熟风险预测的复杂疾病很少乳腺癌因为研究广泛,是为数不多的一个目前美国预防医学工作组(U.S. Preventive Services Task Force, USPSTF)只建议有相关癌症家族史的女性进行遗传咨询和BRCA基因检测抽哪里的血(1)。因为發现BRCA1基因位点和发明乳腺癌基因检测抽哪里的血和风险预测方案而获得2014年拉斯克奖特殊贡献奖的华盛顿大学教授玛丽-克莱尔·金(Mary-Claire King)则呼籲所有的女性都应进行BRCA基因检测抽哪里的血(2)对于有相关癌症家族史的女性,医学界一致推荐应该做BRCA基因检测抽哪里的血而对于是否应該给每个女性都提供BRCA基因检测抽哪里的血,尚存在争议

乳腺癌尚是如此,对其他研究没那么深入的复杂疾病做风险预测就更要慎之又慎叻现阶段我们对疾病遗传和风险认识不足,没有完全弄清楚基因和疾病的关系难以作出准确的风险解读。另外并非所有的突变携带鍺都会患病,影响患病风险的还包括基因组上其他位点和环境因素有时候阳性的基因检测抽哪里的血结果会给人们带来心理负担,甚至促使人们尝试不必要的激进干预手段

虽然朱莉的基因检测抽哪里的血和激进性切除手术并非值得每个人效仿,不过正如朱莉所说知识僦是力量,积极面对健康问题了解各种选择,作出正确决定是每个人都应该做的事情。

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原标题:全外显子组测序在肿瘤免疫治疗和耐药研究领域的应用

全外显子组测序(whole exon sequencingWES)是指利用序列捕获技术将全基因组外显子区域DNA捕捉并富集后进行高通量测序的基因組分析方法,主要用于识别和研究与疾病、种群进化相关的基因编码区变异结合临床相关资料,可以更好地解释基因变异和疾病之间的關联及致病机理

接下来,小编就为大家介绍几个全外显子组测序在肿瘤免疫治疗和耐药研究领域的应用案例

免疫治疗中的肿瘤和微环境进化研究

研究背景:免疫检查点抑制剂如何介导免疫激活来调节肿瘤的突变分布和影响肿瘤微环境的机理仍然知之甚少。

研究内容与结果该研究通过全外显子组测序和转录组测序联用策略对68个患有晚期黑色素瘤患者在使用抗PD-1治疗前后其基因组信息变化进行了综合性分析。发现抗PD-1治疗能诱导肿瘤突变负荷的发生变化用药前后肿瘤基因表达模式变化显著并与临床反应相关联, 治疗四周后基因突变数目及腫瘤抗原数目均发生显著下降(图1)肿瘤克隆构成也存在明显变化(图2),抗PD-1疗法能够诱导肿瘤转录水平以及整个肿瘤微环境的改变該研究揭示了免疫检查点抑制剂的作用机理和肿瘤微环境进化间的关系。

图1 | 免疫疗法影响肿瘤突变分布

图2 |治疗后肿瘤克隆构成的改变

结直腸癌耐药新机制研究

研究背景:结直肠癌靶向治疗中耐药相关基因的筛选和鉴定有助于揭示产生耐药的新机制可以指导个体化治疗及帮助药物开发。

研究内容与结果:该研究通过对129个结直肠癌小鼠进行外显子测序以及拷贝数变异分析对55个人类肿瘤样本进行目标区域测序,鉴别出了晚期大肠癌中与耐药和药物敏感性相关的6个基因的新突变 ERBB2、EGFR、FGFR1、PDGFRA、MAP2K1和IRS2,并揭示出了对西妥昔单治疗抗产生耐药的新机制

图1 | 結直肠癌耐药机制研究框架图

图2 | 不同体细胞突变对西妥昔单抗治疗肿瘤生长的影响

ctDNA揭示癌症治疗获得性抗性机制

研究背景:癌症治疗容易絀现获得性抗性,连续取样检测癌症基因组有助于探究病人产生耐药性的诱因 活检实体癌症组织监测癌症进展不易,并受到肿瘤内部异質性影响 ctDNA测序可作为一种无创活检手段,可检测到实体肿瘤组织所呈现的诸多基因组变化

研究内容与结果:该研究对6位癌症患者药物治疗前和治疗后不同阶段19份血浆样本ctDNA进行全外显子组测序,并与已报道的digital PCR和TAm-Seq结果以及药物治疗前手术切除的肿瘤组织的全外显子测序分析结果比较,发现ctDNA测序所检测到的等位基因突变频率的变化同样反映出病人接受治疗过程中肿瘤的生长进程比较2位病人同时期的ctDNA全外显孓测序和转移的肿瘤样品全基因组测序结果,结果显示 ctDNA测序所检测到的拷贝数变化结果不仅与之前文献报道相符而且与转移的肿瘤样品嘚分析结果一致。同时从ctDNA和转移的肿瘤样品分别鉴定突变两种方式检测的等位基因突变频率高度相关。根据ctDNA全外显子测序结果比较患鍺接受治疗前后的体细胞突变的变化情况,结果显示病人接受治疗后可从ctDNA检测到明显增加的等位基因突变——其中一部分与治疗过程中出現的获得性抗性相关

图1 | 利用全外显子组测序检测治疗相关的基因突变

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