从蔬菜病理学可知番茄枯萎病由尖镰孢菌（又称镰刀菌）引起，而青枯病由细菌引起因而，在识别时可根据病原菌的不同之處进行诊断

方法一：将感病的番茄根或茎切断，放到盛有清水的杯子或碗中搅动几下，若看到有烟雾状的菌脓流出（病理学上称之为“喷菌”现象）则可初步断定为细菌引起的青枯病。若没有则为真菌性枯萎病。

方法二：将番茄病株放入塑料袋内喷洒适量水分后，封口观察两三天后，若发病部位出现白色或粉红色的霉层可据此判断为番茄枯萎病，而细菌性青枯病则无此症状

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