没有保守结构域的基因如何调取同源病保守效果基因ID

点击联系发帖人 时间：2019-05-05 02:06

同源病保守效果

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我在研究一个基因突变对蛋白质的影响在PDB上找到了蛋白质的三维结构，参考文獻说如果突变的氨基酸在保守结构域那对蛋白质功能的影响比较大，但是我用尽了各种方法也还是不清楚怎么查到蛋白质的保守结构域

不知道邀请谁？试试他们

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《五庄观》（又名“万寿山”）

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搜索鉴定基因的保守结构域应該用专门搜索基因的保守结构域工具CD-search，而不是简单的用blast搜索注释快速找到这个基因上的保守结构域，对研究基因的功能是非常重要的洇为行驶相同相近功能的基因往往具有相同的保守结构域！

2.预测单条序列的保守结构域，点击CD-search进入：

粘贴基因的蛋白序列或者是核酸序列都可以，注意为fasta序列如果你知道基因的GI或Accession号，也可以直接数据这些ID就可以查询右方OPTIONS中选择要搜索的数据库，Expect Value等或者使用默认设置，然后按“提交”按钮就可以搜索了；

3.结果查看，默认为concise 简洁显示可以选择full result显示全部内容：

4.批量提交序列搜索保守结构域，Batch CD-Search如下：：

可选择直接粘贴多序列的fasta格式文件，或者提交fasta格式的文件然后选择数据库，如果数据较大搜索时间很久可填写email，搜索完成之后会发郵寄最后点击submit提交就可以搜索了：

5.批量搜索结果展示：

批量搜索结果如下，只展示部分结果详细结果可点击download进行下载（记得勾选full，下載全部结构域信息）或者点击Browse results 进行详细的可视化浏览；

6.批量搜索结果，可视化浏览界面：

可以选中然后浏览，下载等：

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