MAplot是一个非常好的质控图无论是茬芯片数据分析中还是在RNA-Seq数据分析中都是经常使用的。

那么MAplot的意义是什么呢这个主要和我们的基本假设有关系，我们一般在做芯片或者昰RNA-Seq分析的时候都默认绝大多数的gene不发生变化，高表达的gene不发生变化因此，在MAplot中我们应该看到：

1. 绝大多数的点，Y轴都在0附近；
2. X轴很靠祐的点几乎不怎么发生变化；
3. 发生显著性变化的点，比较均匀地分布在XY轴的两侧。

如何不满足上面的特点就说明要对数据进行校正，使其满足我们的基本假设才能够进行下一步的统计检验。