！！！基因组denovo:&测序，组装，注释与分析
1. 测序前的准备
搜集物种相关信息，比如基因组大小，杂合度，
1.1 获取基因组大小
基因组大小的获取关系到对以后组装结果的大小的正确与否判断；基因组太大（&10Gb），超出了目前denovo组装基因组软件的对机器内存的要求，从客观条件上讲是无法实现组装的。
一般物种的基因组大小可以从（&）这个数据库查到。如果没有搜录，需要考虑通过实验（流式细胞仪）获得基因组大小。
1.1.1 流式细胞仪估计基因组大小的例子：
Yoshida, S., J. K. Ishida, et al. (2010). "A full-length enriched
cDNA library and expressed sequence tag analysis of the parasitic
weed, Striga hermonthica." BMC Plant Biol 10: 55.
1.1.2 基于福尔根染色估计基因组大小的描述：
这本书比较经典，重点推荐：Gregory, T. (2005). The evolution of the genome,
Academic Press.
1.1.3 定量pcr估计基因组大小的例子：
Wilhelm, J., A. Pingoud, et al. (2003). "Real-time PCR-based method
for the estimation of genome sizes." Nucleic Acids Res 31(10):
Jeyaprakash, A. and M. A. Hoy (2009). "The nuclear genome of the
phytoseiid Metaseiulus occidentalis (Acari: Phytoseiidae) is among
the smallest known in arthropods." Exp Appl Acarol 47(4):
1.1.4 Kmer估计基因组大小的例子：
Kim, E. B., X. Fang, et al. (2011). "Genome sequencing reveals
insights into physiology and longevity of the naked mole rat."
Nature 479(7372): 223-227.
1.2 杂合度估计
杂合度对基因组组装的影响主要体现在不能合并姊妹染色体，杂合度高的区域，会把两条姊妹染色单体都组装出来，从而造成组装的基因组偏大于实际的基因组大小。
一般是通过SSR在测序亲本的子代中检查SSR的多态性。杂合度如果高于0.5%，则认为组装有一定难度。杂合度高于1%（？）则很难组装出来。
杂和度估计一般通过kmer分析来做，这里有一个例子：
降低杂合度可以通过很多代近交来实现。
杂合度高，并不是说组装不出来，而是说，装出来的序列不适用于后续的生物学分析。比如拷贝数、基因完整结构。
1.3 是否有遗传图谱可用
随着测序对质量要求越来越高和相关技术的逐渐成熟，遗传图谱也快成了denovo基因组的必须组成。构建
遗传图构建相关概念可以参考这本书（The handbook of plant genome mapping: genetic and
physical mapping ）
1.4 生物学问题的调研
这一步也是很重要的
2. 测序样品准备
确定第一步没问题，就意味着这个物种是可以尝试测序的。测序样品对一些物种也是很大问题的，某些物种取样本身就是一个挑战的问题。
基因组测序用的样品最好是来自于同一个个体，这样可以降低个体间的杂和对组装的影响。大片段对此无要求。
3. 测序策略的选择。
一般都是用不同梯度的插入片段来测序，小片段（200,500,800）和大片段（1k, 2kb 5kb 10kb 20kb
40kb）。如果是杂合度高和重复序列较多的物种，可能要采取fosmid-by-fosmid或者fosmid
pooling的策略。
不言而喻，后者花费是相当高的。
4. 基因组组装
4.1 组装相关综述：
Li, Z., Y. Chen, et al. (2012). "Comparison of the two major
classes of assembly algorithms: overlap-layout-consensus and
de-bruijn-graph." Brief Funct Genomics 11(1):
Treangen, T. J. and S. L. Salzberg (2012). "Repetitive DNA and
next-generation sequencing: computational challenges and
solutions." Nat Rev Genet 13(1): 36-46.
Schatz, M. C., J. Witkowski, et al. (2012). "Current challenges in
de novo plant genome sequencing and assembly." Genome Biol 13(4):
Baker, M. (2012). "De
novo genome assembly: what every biologist should
Nat Methods 9(4): 333-337. （重点推荐）
Compeau, P. E., et al. (2011). "How to apply de Bruijn graphs to
genome assembly." Nat Biotechnol 29(11): 987-991.
Birney, E. (2011). "Assemblies: the good, the bad, the ugly." Nat
Methods 8(1): 59-60.&
Schatz, M. C., et al. (2010). "Assembly of large genomes using
second-generation sequencing." Genome Res 20(9):
4.2 测序数据预处理
Yang, X., et al. (2013). "A survey of error-correction methods for
next-generation sequencing." Brief Bioinform 14(1):
Kelley, D. R., M. C. Schatz, et al. (2010). "Quake: quality-aware
detection and correction of sequencing errors." Genome Biol 11(11):
4.3 组装软件比较
Vezzi, F., et al. (2012). "Reevaluating assembly evaluations with
feature response curves: GAGE and assemblathons." PLoS One 7(12):
Salzberg, S. L., A. M. Phillippy, et al. (2012). "GAGE: A critical
evaluation of genome assemblies and assembly algorithms." Genome
Res 22(3): 557-567.
Zhang, W., et al. (2011). "A practical comparison of de novo genome
assembly software tools for next-generation sequencing
technologies." PLoS One 6(3): e17915.
Narzisi, G. and B. Mishra (2011). "Comparing de novo genome
assembly: the long and short of it." PLoS One 6(4):
Lin, Y., et al. (2011). "Comparative Studies of de novo Assembly
Tools for Next-generation Sequencing Technologies."
Bioinformatics.
Hayden, E. C. (2011). "Genome builders face the competition."
Nature 471(7339): 425.
Finotello, F., et al. (2011). "Comparative analysis of algorithms
for whole-genome assembly of pyrosequencing data." Brief
Bioinform.
Earl, D. A., et al. (2011). "Assemblathon 1: A competitive
assessment of de novo short read assembly methods." Genome
4.4 组装质量评估
Schatz, M. C., et al. (2011). "Hawkeye and AMOS: visualizing and
assessing the quality of genome assemblies." Brief
Bioinform.
Riba-Grognuz, O., et al. (2011). "Visualization and quality
assessment of de novo genome assemblies."
Bioinformatics.
个人见解：
目前大基因组的denovo组装主流软件还是ALLPATH-LG SOAPdenovo
ALLPATH-LG的优点是：组装的连续性最好，准确性最好，但是消耗内存较大，不是太好使用
SOAPdenovo的优点是：速度快，消耗的内存可以接受，组装的连续性还可以，但是错误相对要多一些。
当然，上述评述并不是在所有情况下的，对不同物种，不同数据，他们的表现可能会不一样。
基于Overlap-layout的方法的组装软件首推CABOG，这是当年用来组装果蝇基因组的原型。另外，快要发布的MSR-CA貌似也不错，其整合了上述所有软件的优点，来势很猛啊。&
5. 基因组注释
Yandell, M. and D. Ence (2012). "A beginner's guide to eukaryotic
genome annotation." Nat Rev Genet 13(5): 329-342.
6. 基因组可视化
Nielsen, C. B., M. Cantor, et al. (2010). "Visualizing genomes:
techniques and challenges." Nat Methods 7(3 Suppl):
7. 进化分析
Yang, Z. and B. Rannala (2012). "Molecular phylogenetics:
principles and practice." Nat Rev Genet 13(5):
8. 经典案例
Colbourne, J. K., M. E. Pfrender, et al. (2011). "The ecoresponsive
genome of Daphnia pulex." Science 331(6017):
Kim, E. B., X. Fang, et al. (2011). "Genome sequencing reveals
insights into physiology and longevity of the naked mole rat."
Nature 479(7372): 223-227.
Grbic, M., T. Van Leeuwen, et al. (2011). "The genome of
Tetranychus urticae reveals herbivorous pest adaptations." Nature
479(7374): 487-492.
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全部数据均一览无余,但可能有的集团企业没有合并报表,需要分析人士动手自己整理一下.企业名称&&
月销售收入&&
去年同期止累计沈阳新松维尔康科技有限公司&&262.4&&185.4沈阳东宇精细化工有限公司&&64.4山东信得药业有限公司&&87.6仙桃市创世纪卫生材料有限公司&&835.5&&668.4四环药业股份有限公司&&.5北京龙兴科技股份有限公司&&252.4&&519.2北京市福瑞生物工程公司&&378.6&&284.6北京医用离心机厂&&646&&611北京双鹤制药装备有限责任公司&&24.6北京同仁堂营养保健品厂&&133&&47.3北京市乌鸡精厂&&69.1北京双桥制药公司&&550.3&&289.3北京市非凡制药厂&&339.8&&252北京百奥药业有限责任公司&&21.5北京蕾波制药厂&&0&&173.9北京北方生物技术研究所&&50.3北京国药龙立科技有限公司&&78.7北京百慧生化制药有限责任公司&&362.6&&424.6北京第二制药厂&&42.6北京生物制品研究所&&31.9&&491.6中国中医研究院实验药厂&&678.9&&689.7北京协医诊断试剂厂&&124.4&&98.4北京万辉药业集团&&90.5中国北京同仁堂(集团)有限责任公司&&59.6北京博士伦眼睛护理产品有限公司&&647.7北京康达五洲医疗器械中心&&628.5&&481.5北京曙光药业有限责任公司&&51.8北京华洋奎龙药业有限公司&&18.4北京协和药厂&&78.2北京北卫药业有限责任公司&&848.7&&649.8北京中亚九龙科技发展有限公司&&413.6&&491.2北京市红叶齿科医用器材厂&&229.8&&169.5北京万东高星电子产品有限责任公司&&676.6&&713.3北京立时达药业有限公司&&909.5&&966.7北京红惠生物制药股份有限公司&&4.8北京市朝阳洼里医疗器械厂&&155&&667.5北京市双桥燕京中药饮片厂&&652.6&&587.1北京市燕京制药厂&&01.3北京赛蒂克生物技术有限公司&&481.6&&173.7北京普朗新技术有限公司&&594&&572.4北京华尔孚制药公司&&272.5&&340.1北京怡成生物电子技术有限公司&&896.7&&480.7北京欧亚飞制冷设备厂&&3.4&&4.9北京中医药大学药厂&&.8北京东方医用气体工贸公司&&711.2&&708.6北京市鹤延龄中药饮片有限公司&&637.3&&723.8爱尔康（中国）眼科产品有限公司&&06.8北京中卫三广仪器维修站&&20.6北京寿春堂医药保健品公司&&北京益而康生物工程开发中心&&242&&211.7北京市海淀区香山兽药厂&&10.3&&152北京市海淀康达医疗仪器厂&&26.8&&14.3北京市六一仪器厂&&598.8&&384.4北京万辉双鹤药业有限责任公司&&北京紫竹药业有限公司&&398.6北京航天长峰股份有限公司弘华制药机械分公&&805.2&&1290.3北京四环生物制药有限公司&&78.5北京周林频谱科技有限公司&&74中生北控生物科技股份有限公司公司&&.5北京航天长峰医疗器械有限责任公司&&78.3北京海淀中海动物保健科技公司&&597.6&&642.7北京培智科学技术研究所&&0.1&&0.1北京北陆药业股份有限公司&&79.9北京市豪门保健品厂&&26.1&&16.7北京卫仁中药饮片厂&&53.8北京兴华仪器厂&&235.2&&354.6北京双鹤药业经营有限责任公司&&788.7北京市第一生物化学制药厂&&21.8&&57.1北京恩特电子器械公司&&26.8&&55.5北京仁康中药材有限公司&&317&&327.2北京长城制药厂&&56.5北京四环卫生药械厂&&252.6&&1238.6北京市康蒂尼制药厂&&11北京伏尔特技术有限公司&&739.1&&496.5北京麦迪海药业有限责任公司&&714&&631.4北京双鹭药业股份有限公司&&87北京第六制药厂门头沟分厂&&284.5&&344.4北京市志诚堂药业有限公司&&692&&826北京渔经生物技术有限责任公司&&426&&517.1北京琪景饮片厂&&276.1&&403.7北京天骄化工厂&&273.8&&168.3北京四环制药有限公司&&北京人卫中药饮片厂&&766.5&&1302.5北京通州振兴中药饮片加工厂&&294&&458.3北京市华盛兽药厂&&231.4&&141.1北京市通州翟里药材加工厂&&145.2&&338.4北京市通州牛堡屯药材加工&&433.8&&600.5北京通州王家场东方药材加工厂&&348.5&&259.3北京顺鑫祥云药业有限公司&&11.7北京大恒倍生制药厂有限公司&&877.8&&1007.2北京中顺制药厂&&10.8北京益民药业有限公司&&939.7&&491.2北京首儿药厂&&804.2&&842.3北京市利康源医用卫生材料厂&&295&&283北京养元兽药有限公司&&435.4&&401.2北京天惠药业股份有限公司&&4633&&0北京达美康新科技医药研究所有限责任公司&&北京广大制药厂&&339.2&&1148.3北京建生药业有限公司&&01.6北京市中兽药厂&&8.3&&7.5北京市科护医疗器材有限公司&&91.5&&613.5北京长川医用技术有限责任公司&&345.2&&512.6北京康仁堂药业有限责任公司&&978.2&&1210.7北京健力药业有限公司&&77.3北京王朝保健品厂&&110&&187北京三元基因工程有限公司&&66.4北京大兴京信生化制品厂&&98.9&&0北京协和制药二厂&&北京市红星瑞合药材加工厂&&371&&0北京首医临床医学科技中心&&240.7&&0北京市东升制药厂&&989.1&&680北京京铁华龙药业有限责任公司&&86.2北京以岭生物工程有限公司&&41.3北京市延庆机械厂&&219.1&&285.5北京九龙制药厂&&849.5&&435.2北京清华紫光制药厂&&686.9&&795.6北京双鹤高科天然药物有限责任公司&&57.8北京匡达制药厂&&547.7&&521.8天津药业集团有限公司&&&&天津飞鹰工贸集团有限公司&&天津力生制药股份有限公司&&876.3天津市中央药业有限公司&&36.9天津市兽药二厂&&天津中新药业集团股份有限公司&&&&天津市医院设备厂&&123.7&&172.8天津宏仁堂药业有限公司&&90.1天津市理疗仪器厂&&22.7&&25.5天津市生物化学制药厂&&89.2天津市医疗器械二厂&&231.2&&365.7天津市南开区康华医用材料厂&&33.5&&27.2天津市假肢厂&&52.5&&65.7医疗电子仪器公司&&22&&333.7天津市医疗器械工业公司&&618.2&&751.4天津市医疗器械厂&&605.6&&426.5天津爱康药业有限公司&&494.4&&417.3天津市天时高科技发展公司&&2.4&&5.1天津华津制药厂&&961.5国营天津京津医疗器械厂（原三五二九工厂）&&399.6&&280.2天津市河北制药厂&&0&&0天津市中药饮片厂&&86.2天津同仁堂股份有限公司&&.6天津市华新制药厂&&10.4天津市东丽化工厂&&0&&1770天津达仁堂达二药业有限公司&&21.2天津市卫生材料厂&&46.7&&101.3天津中安药业有限公司&&天津市新新药业公司上辛口分厂&&天津市津西津药化工厂&&天津市动物药厂&&247&&255天津市儿童药厂&&156&&352天津市中津药业股份有限公司&&1天津市中药机械厂&&4天津市津津制药厂&&1天津市宏仁中药加工厂&&652&&590天津市中医研究所验药厂&&91&&910天津市河北制药三分厂&&天津市医疗记录纸厂&&879.9&&660.9天津市兴达中药材加工厂&&852&&775天津市新星兽药厂&&宁河县全城电能计量所&&83.2&&64.3天津市福康化工厂&&720&&280天津洪福药业有限公司&&天津市中医研究保健品厂&&560&&600天津市武清区复兴化工厂&&天津市柏海药业有限责任公司&&天津红日药业股份有限公司&&833.7&&691.5天津市亨必达化学合成物有限公司&&406&&209天津天大领先制药有限公司&&246.8&&257天津健生制药有限公司&&815&&719蓟县胶囊厂&&天津开发区海光化学制药厂&&661.5&&552.6华北制药集团有限责任公司&&&&329141河北医科大学生物医学工程中心&&40.4石家庄市宏运卫生材料厂&&175&&187.9河北省高营企业集团公司&&384.3石家庄市桃园企业集团&&0&&29240石家庄市协和制药厂&&470.7&&610.5石家庄市北方制药厂&&95.2&&64.4石家庄神威药业股份有限公司&&3.9河北圣雪医药糖业有限责任公司&&42.4华北制药集团华栾有限公司&&78.1河北圣雪大成制药有限责任公司&&63.7唐山市参花制药集团有限公司&&268.9&&393.1唐山第二兽药厂&&0&&0唐山容大药业有限公司&&518&&469.9乐亭县制药厂&&0&&0唐山市龙山药业有限公司&&808.5&&683.4唐山市第三制药厂&&0&&0遵化市京东制药厂&&秦皇岛市海港兽药厂&&秦皇岛市山海关制药厂&&23.8华北制药秦皇岛有限公司&&01.6邯郸医疗器械厂&&928.3&&702.2邯郸市赵都制药厂&&70.9&&70.9河北省邢台市医用塑料器械厂&&0&&3.2河北省邢台市中兴制药厂&&284.7&&294.3保定古城制药厂&&678.2&&552.3保定兰箭医疗器械厂&&0&&0保定巨微生物工程有限公司&&345&&76.9张家口云峰制药厂&&786.2&&1204.2张家口市长城制药厂&&947&&701河北省承德市爱民制药厂&&100.5&&33.9华北制药天星有限公司&&48.5河北天成药业有限公司&&.7沧州市华大兽药有限公司孝&&640&&354邯郸市赵都精细化工厂&&524.6&&0河北省邯郸市魏县神农制药有限公司&&14.2&&364.2河北宏宝药业股份有限公司&&0&&0河北磁州制药厂&&111.4&&117.8河北东风制药厂&&189.9&&189.9邯郸市久鹏化工实业有限公司&&.2河北省邢台市国金药业有限责任公司&&516.2&&1129.3河北省邢台市南宫市巨龙药业有限责任公司&&431.7&&418.3河北省邢台市沙河市恒利集团公司&&061.9河北省邢台市临西县制药厂&&43.6石家庄市康达制药厂&&800&&804.4河北省石家庄市华龙药业股份有限公司&&.7河北省石家庄市无极县华加胶襄有限公司&&藁城市奥星药业集团有限公司&&79河北阔达生物制品股份公司&&河北金牛制药有限公司&&484&&689.9涿州市东方医疗用品有限公司&&12&&10.6保定三九济世生物药业有限公司&&97.1保定市冀中兽药厂&&329.6&&58.2涿州东乐制药有限公司&&399&&167.6安国市天下康制药有限公司&&317.6&&682.6河北紫薇山制药厂&&820.6&&807河北省张家口市中药厂&&429.4&&0张家口市泰康制药厂&&0&&695.4河北省张家口长胜制药厂&&0&&15.5承德市兽药厂&&0&&51.4河北省宽城制药厂&&238.5&&300.2承德中药集团雾灵药业有限责任公司&&472&&374河北希力药业有限公司&&3.7河北省霸州市长城医用设备厂&&6.8河北海骅制药厂&&221.5&&329.1河北康泰药业有限公司&&0&&0深州市净化设备器材厂&&13.5山西医药集团太原制药有限公司&&81.3山西医科大学制药厂&&449.9&&224.8山西省太原晋阳制药厂&&276.1&&295太原市红星药业有限公司&&509.7&&965.4山西省太原卫生材料厂&&45.8&&199.3山西瑞丰制药有限公司&&99.2太原卫星制药厂&&507.6&&362.5太原世乐药业有限公司&&755.3&&591.8大同星火药业有限责任公司&&74.5大同市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下面还有.洛阳宁竹药业有限公司&&273.4&&270.9洛阳市奔鹿兽药厂&&24.9&&44.5河南华利药业有限责任公司&&32.8河南省平顶山市朝阳药业有限公司&&332.7&&85.5河南省安阳市第一制药厂&&87.1安阳中智药业有限责任公司&&341.7&&156.4安阳市华安制药厂&&520.6&&688.3河南省安阳予北制药厂&&722.3&&938.8河南省安阳康星制药有限责任公司&&631.5&&687.9河南省安阳市益康制药厂&&.8安阳路德药业有限责任公司&&10.3林州市光华制药厂&&277&&780广州白云山制药股份有限公司豫粤制药厂&&618.4&&789.3汤阴县豫鑫有限责任公司&&68.4汤阴县融鑫有限责任公司&&712.1&&663.8鹤壁市中药有限公司&&293.6&&219.8河南时珍制药有限公司&&391.4&&292.2河南省新乡同心制药厂&&258.4&&88新乡佐今明制药股份有限公司&&.5河南新乡征程制药厂&&13.6&&39.2河南省百泉制药有限公司&&45.8河南省新乡市常乐制药厂&&372&&301.3河南省新乡市亨泰药业集团&&5&&0河南省瑞华管业公司&&84.5焦作市中药厂&&357.2&&321.9焦作平光制药有限责任公司&&03.4市协和医疗器械制品有限公司&&394.6&&285河南省濮阳市第二制药厂&&.7濮阳市台前县第三制药厂&&299.8&&253.9漯河市曙光医疗器械厂&&30.5三门峡市第二制药厂&&0&&214.9河南灵一制药有限公司&&35.6三门峡市第三制药厂&&467.5&&804.2商丘市豫东制药厂&&2.1海天动物药品有限公司&&64&&3.6柘城县老君堂制药有限公司&&513.7&&544.9周口市制药机械有限公司&&672.7&&669.4河南省四方药业有限公司&&30.8西华县华丰制药厂&&1.4河南太康亚东药厂&&0&&0河南辅仁药业有限公司&&228.3河南京豫药业有限公司&&9.9河南省神农制药厂&&139.7&&340.9河南龙都制药厂&&550.2&&356.3河南省陈州生物化学制药厂&&320&&813河南省华鑫制药厂&&河南蓝天药业有限公司&&869.5&&372.4河南省健达药厂&&.2驻马店市天河动物药业有限公司&&613.6&&366.2平舆县大自然工业公司&&517.2&&459.6南阳普康药业集团有限公司&&1.8驻马店高杨店金士利保键品有限公&&256.9&&321.8平舆县古槐镇馨星生化有限公司&&7.8河南省宛西制药股份有限公司&&941.1高杨店乡康源加工厂&&497.2&&338.9南阳市宛城区理邦实业有限公司&&367.2&&252.3镇平县晁陂镇华日化工厂&&57.5内乡县全宇制药有限公司&&88.8&&270.3河南福森药业有限公司&&58.8社旗县华茸堂药业有限公司&&.4河南省援生制药股份有限公司&&98.8洛阳市秦岭制药厂&&540.2&&516.6河南省兴邦药业有限公司&&28.1&&579.2河南省济源市济世药业有限公司&&69.2禹州市制药集团有限公司&&8.1武汉五景药业有限公司&&99.7湖北省益康制药厂&&96.1&&142.3武汉华珍药业有限公司&&09.6湖北华润塑胶有限责任公司&&837&&986.5湖北同济华越药业股份有限公司&&298.8&&228.1武汉生物制品研究所&&162.4&&4815武汉生物化学制药厂&&930.9&&1164.2武汉马应龙药业集团股份有限公司&&1武汉健民药业集团股份有限公司&&659武汉制药机械厂&&418&&230.2武汉爱民制药厂&&544.1&&105.8武汉滨湖双鹤药业有限责任公司&&2武汉市中南特种润滑剂厂&&54.1武汉医用材料厂&&192.9&&318.3武汉华泰医疗科技开发公司&&746&&1024.6武汉医保医疗器械公司&&0&&0武汉市武山兽药厂&&640.9&&602.4武汉第六制药厂&&武汉市鄂中制药厂&&401.2&&352.2黄石恒丰医疗器械有限责任公司&&177.9&&148.3黄石飞云制药厂&&79.3湖北省黄石市第四制药&&600.6&&970.6黄石长征制药有限责任公司&&78.8&&75.5三九黄石制药厂&&30.4黄石卫生材料药业有限公司&&871.7&&1185.8黄石市芳通药业有限公司&&26.1湖北亿雄祥瑞药业有限公司&&329.8&&232.4湖北华中药业有限公司&&襄樊隆中药业有限责任公司&&988.5&&721.9湖北天药药业股份有限公司&&77.9谷城芳通皂素有限责任公司&&486.2&&1000.8湖北唐氏俊银医药化工有限责任公司&&鄂州市龙人药业有限责任公司&&684.5&&582.2湖北中天集团公司&&84.2湖北黄冈市宏亚药业有限公司&&06.2麻城市兽药厂&&66.9湖北邦宇药业有限公司&&26.5湖北省黄冈市医药化工厂&&罗田县玉竹药业有限公司&&湖北省应城市医用材料厂&&湖北午时药业有限公司&&.6湖北同济现代鄂北制药厂&&166.9&&27.6吴铺镇武汉大学精细化工厂&&湖北省咸宁市华生制衣厂&&321.1&&418.6通城县福人药业公司&&.6湖北金士达医用器械有限公司&&.6湖北诺得胜制药有限公司&&93.4湖北仙保医用保健制品有限公司&&644.2&&485.1仙桃市第二制药厂&&76.1湖北仙明医疗器械有限公司&&490.8&&384湖北大华制药有限公司&&74.4&&0湖北成田制药有限责任公司&&天门市科田药业有限公司&&974&&648湖北泰丰机械股份有限公司&&546.8&&521.3天门市岳口精细化工厂&&40湖北省荆州制药厂&&334.3&&0湖北省松滋市君健医疗器械厂&&415&&736湖北省松滋市兽药厂&&253&&230.2湖北省太子山制药厂&&988.6&&699.2湖北丹江武当药业有限责任公司&&0&&244丹江口市安泰激素有限责任公司&&513.3&&348.2丹澳医药化工有限公司&&08.4店子龙鑫加工厂&&302.1&&184.4十堰纯阳生化科技有限公司&&477.3&&0郧西县百科皂素有限公司&&19.7房县天马医化有限责任公司&&8.8湖北峰江氨基酸有限公司宜昌分公司&&55.8长阳制药厂&&0&&0利川市香莲药业有限责任公司&&343&&0随州活化石生物保健工程公司&&307.6&&1748.7随州市明星药业有限公司&&382.1&&403.9湖南安邦制药有限公司&&852.2&&441.7珠海金沙(湖南)制药有限公司&&27.4湖南洞庭药业股份有限公司&&55湖南正清制药集团白云山正清制药总厂&&17.1湖南迪诺制药有限公司&&8.5马王堆制药厂&&278.4&&246.1长沙长城制药厂&&261.8&&256.8湖南制药有限公司&&10.2中南制药机械厂&&164.2&&363长沙橡胶制品厂&&909.3&&693.8湖南省动物药厂&&445.1&&245长沙正中药机高新技术开发公司&&199.9&&367长沙金农生物资源股份有限公司&&44.5长沙东风药业有限公司&&3.2长沙制药三厂&&262.5&&265长沙丽康生化工程有限公司&&7.8&&1034.6湖南省浏阳市医用仪具厂&&950&&294湖南省株洲制药厂&&0&&88.2株洲市奇迹中药饮片有限责任公司&&85.3&&182.1株洲市湘东氨基酸有限公司&&278.1&&189茶陵县制药厂&&219.8&&69.1湖南一格制药有限公司&&570.5&&546.3湘潭飞鸽药业有限公司&&29.4湖南绅泰**业有限公司（原湘潭制药三厂）&&867&&374.1湖南五洲通医药有限公司&&韶山市世源兽药厂&&642.4&&308湖南六合医疗保健用品公司&&161.2&&174.6湘潭县药材公司驴胶加工厂&&202&&201.1湖南三九唯康药业有限公司&&53.4衡阳中药饮片厂&&99.9&&124.5衡阳市康达动物药业有限公司&&344&&235.2清华紫光古汉生物制药股份有限公司&&254.6衡阳益泰药业有限公司&&61.5&&50.7衡阳市制药器械厂&&248&&404.3湖南爱民制药有限公司&&衡阳东健药业有限公司&&2.2湖南省湘中制药有限公司&&邵阳市裕丰医药化工有限公司&&435&&360湖南郎力夫制药有限公司&&72湖南省岳阳市制药三厂&&622.8&&881.2岳阳中湘康神药业集团有限公司&&06.4湖南天御龙药业有限公司&&110.7&&551.2临湘市康大有限责任公司&&201&&0.1湘阴县华中医药原料厂&&93.8&&0湘阴县湘北动物药品厂&&46.4&&0平江县金寿制药有限公司&&968.8&&737.7平江县天岳制药厂&&29.5&&27.7常德贝丹药业有限公司&&693&&0湖南德海制药有限公司&&574&&1070.6康力来医疗器械有限公司&&713.5&&420.2长沙市泰宝制药有限公司才松堂制药厂&&199.2&&435.6张家界市长康制药有限责任公司&&416.1&&739.1湖南汉森制药有限公司&&02.7冷水江市制药厂&&918.1&&1957.2湖南省回春堂制药厂&&湖南三九南开制药有限公司&&99.8湖南时代阳光零陵制药有限公司&&37冷水滩医疗保健有限责任公司&&140.1&&520.5永州市凤凰园百草制药有限公司&&98宁远县天然药物提制厂&&432.6&&334中南制药机械一厂&&祁阳县中兴制药机械有限责任公司&&593.1&&217.5怀化正好药剂有限公司&&23.1怀化市生物化工总厂&&60&&58.9怀化市植化药提制&&542&&342洪江市正兴医疗仪表厂&&236.5&&185.8永顺卫生材料有限公司&&0&&343湖南省永顺县猛洞河医药保健品有限责任公司&&709.5&&152湖南省耒阳市康寿制药厂&&96.8&&352.8广东省假肢康复中心&&557.9&&300.5广东省生物药厂&&33.1广东省广昌动物保健品公司&&355.2&&376.6广东省惠阳机械厂&&602.7&&857.8广东省五丰联营动物保健品厂&&0&&345广州白云山企业集团有限公司&&0&&659中山大学达安基因股份有限公司&&31.5广州市花城制药厂&&45.4广州珠江制药厂&&561.2&&936.1广州市国营横江中药加工厂&&377.9&&398.3华南农业大学实验兽药厂&&914.6&&543.6中山医科大学仪器厂&&20.2&&10.8广州中一药业有限公司&&2.6广州陈李济药厂&&982广州环叶制药有限公司&&97.5广州何济公制药有限公司&&34.9广州侨光制药有限公司&&684.8广州卫材制药有限公司&&50.9广州明兴制药有限公司&&59.7广州敬修堂（药业）股份有限公司&&61.3广州羊城药业股份有限公司&&545.9广州天心药业股份有限公司&&253.8广州光华药业股份有限公司&&1.2广州潘高寿药业股份有限公司&&580.7广东天普生化医药股份有限公司&&45.4广州东康药业有限公司&&771.8&&1323.9广州诺贝华乐制药厂&&207.5&&346.3广州星群（药业）股份有限公司&&449.1珠江水产研究所水产药物实验厂&&524.7&&561.8广州市激光技术应用研究所&&115.7&&127.8广州市消毒制品有限公司&&295.1&&286.5广州白云医用胶总公司&&679.9&&446广州市花都区华兴塑料制品厂&&299.7&&359.5广州温泉药物厂&&增城市镇龙中药提炼厂&&94.8荔城镇增江中药加工厂&&369.3&&295.5广东太阳神集团荔城制药厂&&791.3&&2297.6广州市番禺区纤维素综合厂&&395&&366.4广东省医疗器械厂&&328&&413.7韶关市生物化学制药厂&&14.6&&71.7广东佰易药业有限公司&&67.5翁源县青云山中药厂&&473.7&&62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