Date: December 10, 2015
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基于过渡态理论计算反应速率常数的Excel表格
Created by Sobereva, 2015-Dec-10
这个是基于过渡态理论计算单分子和双分子反应速率常数的Excel表格，给大家提供个方便，把Gaussian等程序计算的活化自由能，或者反应物和过渡态的配分函数填进去就可以得到结果。附带个通过Wigner方法根据虚频计算隧道效应透射系数κ的子表格，如果要这个方法算出来的κ，把得到的κ填到表格左上方的参数部分即可。
使用方式不言自明，并且有注释，就不多说了。
评论已关闭var searchResultHtml=$("#tabSearchResult").html();
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题名: 单分子研究和定位单分子反应
作者: 李宾
学位类别: 博士
答辩日期: 2005
授予单位: 中国科学院上海应用物理研究所
授予地点: 中国科学院上海应用物理研究所
导师: 李民乾
关键词: 单分子反应
&蘸笔&纳米刻蚀技术
脱氧核糖核酸酶I
单个DNA分子
其他题名: Single Molecule Studies and Site-specific Reactions onIndividual Biomolecules
学位专业: 粒子物理与原子核物理
中文摘要: 在单个分子水平上对生物大分子进行探测和操纵是目前生命领域研究的热点之一。本文提出一种基于原子力显微术的纳米操纵技术来实现生物大分子的定位单分子反应方法。本研究采用"蘸笔"纳米刻蚀技术（DPN），通过对单个拉直DNA分子进行纳米定位修饰，研究脱氧核糖核酸酶I（DNasel）对单个DNA分子的酶解作用，以期实现对"单个DNA分子反应位置的人为控制，为基于酶解反应的DNA分子手术、DNA测序、DNA插入和修饰等研究提供新的思路。在定位单分子反应过程中分为三部分：宏观水平的衬底修饰和DNA拉直操纵；纳米水平的DNasel定位修饰；单分子水平的反应过程观测。衬底修饰技术和定位修饰技术是其中最关键的步骤。修饰衬底的亲水性和疏水性程度直接影响DNasel在单个DNA分子上定位修饰的精度；修饰衬底与DNA分子之间相互作用的程度将影响酶和DNA反应的效率。所以本研究十分注重不同修饰方法对定位酶解DNA分子的影响。DPN技术是实现DNasel在DNA分子上纳米级定位修饰的良好途径。利用我们发明的动态组合模式DPN技术，成功地将DNasel沉积在单个DNA分子预先选定的位置上。通过控制反应条件，已经初步实现了DNasel对DNA分子的定位酶解反应。
语种: 中文
内容类型: 学位论文
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单分子研究和定位单分子反应.李宾[d].中国科学院上海应用物理研究所,
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单分子消除反应
单分子消除反应（E1反应，E代表Elimination) 反应物先电离，离去基团断裂下来，同时生成一个，然后失去β氢原子并生成π 键。反应分两步进行，决定速率这一步（决速步）只有反应物分子参加。故E1的速率与反应物的浓度成正比，与碱的浓度无关。单分子消除反应，而1代表反应速率只受其中一个化合物浓度的影响），由于反应的速率控制步骤只与一个底物分子有关，是单分子过程，在反应动力学上是，故称为“单分子消除反应”。
单分子消除反应基本性质
由于中间体碳正离子会发生重排，故E1反应会得到重排产物。E1反应的区域选择性与E2反应相同，反应物有两种不同的β-氢时，反应遵循查依采夫规则，主要生成稳定的烯烃。产物烯烃有时，以E型烯烃为主。
单分子消除反应与双分子消除反应和单分子亲核取代反应为竞争反应。当卤代烃在碱作用下消除时，由于C-X键远不如C-H键容易断裂，因而消除反应一般都采取E2机理。只有三级卤代烃在极性溶剂中溶剂解或醇失水时，反应才为E1机理。与SN1机理相对比，E1反应和SN1反应第一步都为卤代烃的异裂，故离去基团的离去难易程度并不影响这两种机理的竞争，只有第二步中亲核试剂与碳正离子的结合方式决定了这两种机理的比例。试剂亲核性越强，空间位阻越小，对SN1机理越有利。因此在和无强碱存在时，取代产物是主要产物。[1]
单分子消除反应历史研究
克里斯托夫·英果尔德(Christopher Kelk Ingold)与罗伯特·鲁宾逊(Robert Robinson)展开了一连串有机化学的研究，提出了许多现代有机化学里的观念，像是亲核性、亲电性、SN1反应、SN2反应、E1反应、E2反应等等都是在他们研究后先后提出来的崭新概念，这些概念的提出对揭示有机反应内在机理从而实现控制有机反应起到了巨大的促进作用，而E1反应，就是他们提出来解释消除反应的其中一项反应机构。
单分子消除反应反应机理
单分子消除反应机理
第一步是底物分子的离去基团离去，生成中间体，这一步较慢；
第二步是溶剂分子夺取碳正离子β-氢，生成烯烃。由于反应的速率控制步骤只与一个底物分子有关，是单分子过程，在反应动力学上是一级反应。 例子：
单分子消除反应
单分子消除反应相关扩展
单分子消除反应共轭碱单分子消除反应
反应物先与碱作用，失去β氢原子，生成反应物的共轭碱碳负离子,然后从这个碳负离子失去离去基团并生成π键。在生成π键的步骤中只有共轭碱碳负离子参加。[2]
共轭碱单分子消除反应（E1CB）也分两步进行，反应速率不仅与反应物浓度成正比，也与碱的浓度有关，其关系较复杂，在多数情况下也成正比。一般说来，只有β碳原子上连有硝基、羰基或氰基等足以稳定碳负离子的强吸电子基团的反应物，才能按E1CB机理进行反应
单分子消除反应双分子消除反应
反应一步完成，离去基团的断裂、β氢原子与碱中和、π键的生成三者协同进行（见协同反应），反应物和碱同时参加反应。E2的速率与反应物浓度和碱浓度都成正比。有些E2中，β氢的断裂稍先于离去基团的离去，情况在一定程度上与E1CB相似，称为“接近E1CB的E2”；另一些E2的情况刚好相反，离去基团的离去稍先于β氢的断裂，在一定程度上与E1相似，称为“接近E1”的E2。一般的E1、“接近E1的E2”和典型的E2等反应都以发生扎伊采夫消除为主，而E1CB和“接近E1CB的E2”却以发生霍夫曼消除为主。[3]
单分子消除反应应用
当卤烷类以亲核性碱处理时，E1与SN1反应是一起竞争的。因为最好的E1反应物也是最好的SN1反应物，因此脱去及取代的产物两者常会混在产物中，例如2-氯-2-甲基丙烷在65°C，80%的乙醇中会产生64：36比例的2-甲基-2-丙醇(SN1)和2-甲基丙烯(E1)的混合物。
．中国知网[引用日期]
．万方数据[引用日期]
．中国知网[引用日期]
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有重排。影响SN1最主要因素就是C正离子的稳定性。形成C正离子越稳定越容易发生SN1，所以活性有伯仲叔季依次增加的规律。另外催化剂位阻大的。而影响SN2反应的关键因素是空间位阻，所以活性顺序刚好相反，外消旋SN1会形成C正离子，也容易发生SN2。 这种题不用怕，因为SN1、SN2反应并不是我们想象中那么绝对的，所以要是考这样题会比较明显
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