代谢组学数据分析新人,求教

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【求助】求推荐做代谢组学的公司
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最近想做血清和尿液的LC-ms代谢组学,坛子里有没有知道靠谱的公司的,最好上海苏州附近的
不知道邀请谁?试试他们
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请问你最后找到了么?我也需要
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上海博苑科技还不错
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【求助】代谢组学的费用
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这个帖子发布于5年零309天前,其中的信息可能已发生改变或有所发展。
谁知道一份代谢组学标本检测的费用啊
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那要看你是什么样本,做哪些检测。现在代谢组最主流的检测方法应该有两种,一种是LC-MS-MS,一种是NMR。说说你的样本是什么样类型的,有多少量,需要检测什么代谢物(是越多越好,还是特定的那几种),样本的数量,检测的周期等。
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我也想知道
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我们公司的报价是一份样品1000元,量多可以优惠 上海敏芯信息科技有限公司是国内较早专业从事代谢组学的公司,09年至今已经发表多篇代谢组学SCI论文,涉及LC-MS,GC-MS和NMR平台(包含实验及数据分析),是国内最专业的代谢组学服务商。欢迎咨询,网站(021-)发表的SCI论文列表复旦大学: Jiaoran Menga, Xiaodong Zhangb, Hao Wuc, Jing Bua, Chenyi Shia, Chunhui Denga,Yu Maob, Morphine-induced conditioned place preference in mice: Metabolomic profiling of brain tissue to find “molecular switch” of drug abuse by gas chromatography/mass spectrometry,Analytica Chimica Acta.2011.IF=4.31中山医院:Hao Wu, Ruyi Xue , Huazong Zeng, Xizhong Shen et al., Metabolomic profiling of human urine in hepatocellular carcinoma patients using gas chromatography/mass spectrometry, Analytica Chimica Acta,648 (4.IF=4.31中山医院:Wu H, Xue R, Tang Z, Deng C, Liu T, Zeng H, Sun Y, Shen X , Metabolomic investigation of gastric cancer tissue using gas chromatography/mass spectrometry , Anal Bioanal Chem. ):1385-95. IF=3.841中山医院:Hao Wu, Huazong Zeng, Xizhong Shen et al., Metabolomic study for diagnostic model of oesophageal cancer using gas chromatography/mass spectrometry, Journal of Chromatography B, 877 (–3117.IF=2.971 中山医院:Wu H, Xue R, Tang Z, Deng C, Liu T, Zeng H, Sun Y, Shen X , GC/MS-based metabolomic approach to validate the role of urinary sarcosine and target biomarkers for human prostate cancer by microwave-assisted derivatization.IF=3.78浙江大学附属第一医院:Feng Chen, Zhi Chen, et al., Identification of Serum Biomarkers of Hepatocarcinoma through Liquid?Chromatography/Mass Spectrometry-based Metabonomic Method, Anal Bioanal Chem.IF=3.841
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请问zhz76217楼主,我刚开始做代谢组学,您说的一份样品1000元,包括数据处理吗?您方便留下您的QQ吗,我想和您交流一下
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我记得当时我做的是200块钱一个
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还有那些正在做啊?急需帮助。
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关于丁香园关注今日:11 | 主题:315297
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代谢组学样本数目求助
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本人新手一枚,最近想送样本测代谢组学,但是由于前期饲养问题导致样本每个处理的重复是5个样本,总共四组也就是二十个样本,测序回来后还想写篇小点的英文,想咨询下大神,这个样本可不可以送样测序。主要是没有机会再养同样一批做处理了,求指教!!!!!
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没看懂楼主到底要做代谢组学分析还是高通量测序,如果是代谢组学这个样本量是妥妥不够的
做代谢组的单组样本量也要20个。你这个只能做高通量测序。
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oudu88557 没看懂楼主到底要做代谢组学分析还是高通量测序,如果是代谢组学这个样本量是妥妥不够的
做代谢组的单组样本量也要20个。你这个只能做高通量测序。谢谢大神能回复,我主要是想做一个代谢组学,样本是雏鸡下丘脑,不确定这样子的样本量在做代谢组后,能不能写英文文章,样本量这个问题确实很苦恼
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晒太阳的小蜗牛 本人新手一枚,最近想送样本测代谢组学,但是由于前期饲养问题导致样本每个处理的重复是5个样本,总共四组也就是二十个样本,测序回来后还想写篇小点的英文,想咨询下大神,这个样本可不可以送样测序。主要是没有机会再养同样一批做处理了,求指教!!!!!嗯,美吉生物这方面比较有经验
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样本重复是有一点少,不知道样本的重复性如何,就是个体差异是否大,我们这边也做过大型动物的5个重复也发表了文章的,倒也不是绝对的生物重复少就不能做,要看具体情况。
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楼上正解。一般实验室培养的植物,微生物取样6个平行实验室饲养的动物(大小鼠,兔、鸡等)10个平行如果样本数量偏少,看样本间个体差异性大不大。另外可以考虑一只动物取两份样本。如果模式识别OK, 再补点靶标验证实验,发个小文章还是OK的有问题欢迎联系。
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代谢组差异分析一般是基于PCA\PLS-DA等统计分析方法进行的,在样品准备上相对于转录组和蛋白质组而言需要更多的重复数据,一般建议植物微生物样品每组最少8次以上重复数据,模式动物在10次以上,临床标本在30例以上。样品采集后需及时放入液氮或-80度冰箱冻存。
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阿趣生物 楼上正解。一般实验室培养的植物,微生物取样6个平行实验室饲养的动物(大小鼠,兔、鸡等)10个平行如果样本数量偏少,看样本间个体差异性大不大。另外可以考虑一只动物取两份样本。如果模式识别OK, 再补点靶标验证实验,发个小文章还是OK的有问题欢迎联系。可否请教您一个问题?如果第一步用代谢组学找出了marker,那么第二步验证时,样本量需要多少呢?
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请教一下,代谢组学的东西,发文章,往哪儿投稿啊,用液质和核磁做的
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