人类结直肠腺癌EST序列ES274081的生物信息学分析--《中国解剖学会2012年年会论文文摘汇编》2012年
人类结直肠腺癌EST序列ES274081的生物信息学分析
【摘要】：正结直肠腺癌是我国一种常见的恶性肿瘤。多数病人不能早期发现,复发与转移率高。因此研究结直肠腺癌的发病基因,将为结直肠腺癌早期诊断和治疗提供理论依据。我们对人结直肠腺癌EST片段(ES274081)及其所编码蛋白质进行生物信息学分析,预测其结构及功能,为进一步的实验验证做基础。首先在G-enbank中获取该片段的全长cDNA,利用ORF寻找起始密码子并翻译为氨基酸序列。得到氨基酸序列后利用互联网上的生物信息学软件及工具、程序等分析该氨基酸序列的理化特性,如等电点、疏水性、磷酸化及糖基化等。利用
【作者单位】：
【分类号】：R735.3【正文快照】：
结直肠腺癌是我国一种常见的恶性肿瘤。多数病人不能早期发现，复发与转移率高。因此研究结直肠腺癌的发病基因，将为结直肠腺癌早期诊断和治疗提供理论依据。我们对人结直肠腺癌ESI，片段(ES274081)及其所编码蛋白质进行生物信息学分析，预测其结构及功能，为进一步的实验验
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【讨论】EST分析思路。
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这个帖子发布于11年零162天前，其中的信息可能已发生改变或有所发展。
不知道我的主题对不对.手上拿到了cDNA文库测序的1000多条序列,偶不知道如何下手了,从来没接触过生物信息学啊,哭死.怎么去分析呢?1.先看丰度?(叫重复序列还是什么?)2.怎么看丰度啊?拼装?用什么软件呢,偶这里只有windows操作系统.3.然后再去做blast?跟EST库比,要不要跟蛋白库比啊.blastx??还要分析什么呢?我不知道啊?各位兄弟姐妹,赶快帮帮我吧.最好给我个分析流程.感激不尽
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高枕无忧 edited on
给我就好了
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duziteng 给我就好了给你我就不能毕业了:P别开玩笑,老兄应助一下子呗!
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生物信息的分析可以参照一下这篇文章，PMID: 9465292 ，对前列腺1000多条cDNA测序结果的分析。
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谢谢&肚子疼&老兄.:D:D:D我先看看吧.但是那些丰度分析怎么进行呢?
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取笑了，网上有很多丰度预测的软件，具体见www.bio-soft.net因为我没有做过这方面，所以也说不了什么，关于cDNA的分析很多，有自己测序的材料是非常好的，起码文章的档次也不会低，你自己多看下人家分析的文章，就知道怎么分析了。以后换个id了......
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继续讨论吧欢迎各位战友不吝赐教！谢谢哈
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后继分析包括：比较基因组学分析基因表达谱分析新基因研究基因可变剪切分析实验验证MicroArrayGeneChipRT-PCRNorthern blotting另我这有一个大规模表达序列标签（EST）测定及分析的PPT,你先网上收一下，找不到我再给你传过去，这里面有很好的操作说明，再有园子里有过一个关于EST的讨论，已经成集，也很好的，找一下。
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