如何跑一个好看的双向电泳原理

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双向电泳原理及实验步骤
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双向电泳操作步骤
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有做过双向电泳的进来聊聊啊
LZ最近需要做双向电泳,用的是从植物组织中提取的蛋白质,可是没做过等电聚焦电泳。而且提取的蛋白样品也不清楚是直接在离心后取上清-80℃冷藏 还是 真空冷凝干燥以粉末状保存。SDS-PAGE也和平时跑电泳时不同,毕竟等电聚焦后的IPG胶条在SDS时要用到。
当然现在最想了解的是蛋白质的保存状态,是上清还是干粉?小伙伴在哪?求支援
冻干粉的意义主要在于浓缩样品浓度,易于保存,如果你蛋白达到双向电泳要求浓度就可以直接上样,越少步骤对蛋白完整越好
不知道是否有用,可以看看:步骤:
北京学而思教育科技有限公司 地址:北京市海淀区北三环甲18号中鼎大厦A座1层102室 电话:010-& 【求助】双向电泳上样量如何确定
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【求助】双向电泳上样量如何确定
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【求助】双向电泳上样量如何确定
各位高手,我处理完样品,用Pierce公司的Coomassie(Bradford) Protein Assay Kit测样品的蛋白浓度,之后定上样量,用1mg,再用18cm的IPG胶条跑第一向。结果发现,胶间的点差别很大。所以想请教各位,如何确定双向电泳中的上样量。(图太大,贴不上来!)
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你的图做的挺不错的
但好像你问的如何确定上样量的问题,不是你的主要问题。
如何确定上样量,要根据你的实验目的啊,想总体跑张漂亮的图,象你第一张就挺不错的了
如果是想关注观察其中某部分点,让有些点更清楚,你就要调整上样量,其他点不清楚也无所谓啊。还有看你是用于软件分析还是质谱鉴定等等,目的不同,上样量肯定不同啊
你的问题不是如何确定上样量的问题,而是如何提高重复性的问题。
蛋白质从定量到泡涨到最后下胶到染色
定量不准确,蛋白丢失,染色深浅等有好多因素影响
主要还是从定量和染色找找原因吧,操作也要稳定才行。
顺便帮你把图贴上来
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我现在的问题是要找正常组和诱导组的差异点,从图上看,左边的是正常组,右边的是诱导组,上样都是1mg左右,可跑出来的结果发现正常组的点多于诱导组,而且量也大一些!这样找差异点就很难,因为量不一致!
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原帖由 菠萝喵 于
17:33 发表
我现在的问题是要找正常组和诱导组的差异点,从图上看,左边的是正常组,右边的是诱导组,上样都是1mg左右,可跑出来的结果发现正常组的点多于诱导组,而且量也大一些!这样找差异点就很难,因为量不一致! ... 是同步跑得同步染色吗?
还是前面说的那些因素
1、有可能你的定量不准吧
2、如果不是同步,操作上的误差
3、即使同步,操作上也可能存在误差,例如加样,吸收情况,平衡过程的蛋白质丢失,二项蛋白质的转移等等。
4、准确定量,或者尽量提高两组定量的一致性、可比性(有时定量本身会误差,但尽量提高两者可比性)
5、操作稳定减少误差
6、软件分析时可以对图的点取VOl%,对于有些点也不是完全不可比,但还是尽量不要用这些图正式比较。
这是我的全部经验,都告诉你了
祝你好运!
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弱弱的问一句,请问楼主,你是哪里的研究生?因为我也马上要做2-DE,但还不知道到哪里去做!
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楼主,你做的是细胞诱导蛋白?特别是碱性端还不错,能否给出你的2DE样品处理条件()?我做细胞病毒的,正常组的点也多于病毒组,我想不完全是量和操作的问题吧。
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我觉得跟染色程度有关,不好控制的说
不要指望2DE来定量,最多只能大致分析一些差异点,然后进行MS分析
另外,需要多重复几次,统计学意义要考虑进去,
将来发文章也要这方面的数据的~~~~
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支持子衿青青。最主要的问题可能还是蛋白定量是否准确。
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我看了一下,主要是你两块胶的脱色脱得不一样,背景的深度不同,你可以把深的那块再脱一下。还有软件分析胶上点的浓度还是不太可靠,建议还是先用软件找,找用眼睛看来确定。
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同意上面几位的意见。我感觉主要还是蛋白定量是否准确地问题,建议你重新定量后,再重复一次;注意每一步操作都要条件一致,准确加样。
Good Luck!}

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