知道基因的CDs区和基因组序列,如何找该基因的3‘UTR区?
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ncbi上blast,先知道是什么基因,再查此基因的全序列
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【求助】请教ensembl最新版的使用方法。
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这个帖子发布于4年零341天前，其中的信息可能已发生改变或有所发展。
最近要克隆人的PDGFB启动子，网上介绍ensembl搜索启动子非常强悍，但是对比曾今的使用方法，发现如今的网站又改版了，我能够看到图谱下游promoter的图标，但是怎么都调不出启动子的序列，万分着急！急盼各路高手出手相救！！！
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非常谢谢！已经找到方法了，但是发现用Ensembl得到的启动子序列和UCSC得到的启动子序列是很不一样的，也不知道该相信哪一个……
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关于丁香园请教:3UTR序列分析 - 实验交流 - 生物秀
标题: 请教:3UTR序列分析
摘要: 请教:3UTR序列分析大家好，我现在在一个基因3UTR的1600bp的长度中找到一个SNP位点，但是不知道从影响基因的功能方面如何分析，用什么软件来预测3UTR序列结合位点？谢谢！ 关键词:[序列分析 基因 位点 序列 结合位点]……
大家好，我现在在一个基因3UTR的1600bp的长度中找到一个SNP位点，但是不知道从影响基因的功能方面如何分析，用什么软件来预测3UTR序列结合位点？谢谢！回复:
you may use targetscan 4.2
very useful tool in dealing with 3"UTR回复:
是在线的。很好，非常感谢
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历史上的今天
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blogAbstract:'1.& 进入Ensembl网站\r\n2.& 点击屏幕又上方的\"BioMart\"\r\n3.& 选择数据库& 人的数据库& Data：Ensembl 54\r\n&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&Data set：Homo sapiens genes(NCBI36)\r\n4.& 点击屏幕左边菜单的\"Filters\"\r\n5.& 点击\"gene\"，在ID list limit中选择HGNC symbol，把基因名贴入下面的方框内\r\n6.& 点击屏幕左边菜单的\"Attributes\"& 在\"Gene\"中 去掉 Ensembl Transcript ID\r\n&&&&&&&',
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